(一)補助研究計畫集中於特定學校機關
100年度至104年度科技部補助學校機關從事學術研究，以專題研究計畫加計國家型科技計畫補助金額為基準之前10大執行機構，各年度均為國立臺灣大學(簡稱臺大)、國立成功大學(簡稱成大)、中央研究院(簡稱中研院)、國立清華大學、國立交通大學、國立中央大學、國立中興大學、國立中山大學、國立臺灣師範大學及國立陽明大學，經費排名變動不大，上開學校每年度經費合計介於97億餘元至99億餘元間，占科技部補助專題研究計畫加計國家型科技計畫總經費之53％至55％。其中臺大、成大及中研院各年度均名列前3名，台大補助金額介於27億餘元至28億餘元間，成大補助金額介於13億餘元至14億餘元間，中研院介於10億餘元至11億餘元間，前3大執行機構補助經費合計近總經費之3成(詳附表4-1)。
附表4-1：近5年科技部補助專題研究計畫及國家型科技計畫之執行機構排名情形－以補助金額為基準
單位：新臺幣千元
排名
執行
機構
100年度
101年度
102年度
103年度
104年度
1
臺大
2,872,871
2,742,027
2,776,197
2,751,562
2,774,183
2
成大
1,379,970
1,383,213
1,385,672
1,433,244
1,396,137
3
中研院
1,147,340
1,116,199
1,072,182
1,067,909
1,076,075
1-3小計
5,400,181
5,241,439
5,234,051
5,252,715
5,246,395
4-
10
清大等7家
4,493,088
4,500,387
4,583,936
4,720,046
4,474,914
1-10小計
9,893,269
9,741,826
9,817,987
9,972,761
9,721,309
總經費
18,150,053
18,398,368
18,265,893
18,461,491
18,275,603
1-3占總經費比率
30%
28%
29%
28%
29%
1-10占總經費比率
55%
53%
54%
54%
53%
※註：1.資料來源，科技部提供，本報告整理。
2.清大等7家包括國立清華大學、國立交通大學、國立中央大學、國立中興大學、國立中山大學、國立臺灣師範大學及國立陽明大學。
(二)補助資源集中於部分主持人
監察院101年度糾正案指出，「98至100年國科會補助計畫主持人於同一期間擔任5件以上（含5件）計畫者，各有50人、28人及5人」經監察院糾正後，科技部自101年7月23日起函訂補助單一計畫主持人計畫件數核給基準，原則上同一執行期間合計總件數不得超過4件，補助單一主持人之計畫件數已較以往改善，並無超過5件之情形，然仍有補助資源集中於部分主持人之情事，說明如下：
1.補助件數：101年度至104年度主持1件計畫之主持人占大多數，平均每年有1萬4,185人，惟主持3件以上計畫者，平均每年有276人(詳附表4-2)。換言之，平均84.9％之計畫主持人主持1件計畫，卻有1.7％之主持人主持3件以上計畫，逾行政院委託研究計畫要點之原則性2件計畫限制。
附表4-2：單一計畫主持人計畫件數之人數分布情形
單位：人
主持人
計畫件數
101年度
102年度
103年度
104年度
平均
1件
14,594
14,206
13,990
13,949
14,185
2件
2,317
2,223
2,231
2,194
2,241
3件
277
243
262
240
256
4件
21
20
17
21
20
5件
0
0
0
1
0
合計
17,209
16,692
16,500
16,405
16,702
※註：1.資料來源，科技部提供，本報告整理。
2.補助金額：101年度至104年度獲得計畫補助金額不超過100萬元者占大多數，平均每年有1萬0,499人；其次為101萬元至500萬元之區間，平均每年有5,769人。然獲補助超過3,000萬元者平均每年有23人，其中超過5,000萬元者平均每年亦達10人，103年度及104年度各有1人年獲補助逾億元(詳附表4-3)。換言之，平均97.4％之計畫主持人獲得不超過500萬元之補助，卻有0.1％之主持人獲得超過3,000萬元之補助，甚至有逾億元之情形，補助金額差距甚大。另101年度至104年度任一年度單一計畫補助金額超過3,000萬元之計畫名稱、經費等概況詳附表4-4。
附表4-3：單一計畫主持人計畫金額之人數分布情形
單位：人
主持人
計畫金額
101年度
102年度
103年度
104年度
平均
100萬元以下
11,386
10,527
10,056
10,026
10,499
101萬元
至500萬元
5,388
5,769
5,997
5,922
5,769
501萬元
至1,000萬元
301
265
318
329
303
1,001萬元
至3,000萬元
119
109
102
103
108
3,001萬元
至5,000萬元
12
10
14
14
13
5,001萬元
至1億元
3
12
12
10
9
1億元以上
0
0
1
1
1
合計
17,209
16,692
16,500
16,405
16,702
※註：1.資料來源，科技部提供，本報告整理。
附表4-4：101年度至104年度任一年度單一計畫補助金額超過3,000萬元之經費概況
單位：新臺幣千元
主持人
計畫名稱
101年度
102年度
103年度
104年度
多年期計畫
(年度/合計)
王ＯＯ
甲烷水合物海域探測與採樣工程技術之研發
-
30,800
-
-
-
王＃＃
智慧電子設計環境建置計畫
75,051
78,822
-
-
100-102/
248,867
智慧電子晶片設計、製作及測試環境建置計畫
-
-
92,666
91,970
103-104/
184,636
王＊＊
台灣北部地熱鑽井計畫
-
-
198,565
-
-
江ＯＯ
果蠅神經網路體計畫
-
70,000
70,000
70,000
102-104/
210,000
吳ＯＯ
跨國頂尖研究中心－跨國頂尖生醫工程研究
40,000
40,000
40,000
-
99-103/
200,000
宋ＯＯ
宜蘭地區深層地熱資源探勘及加強型地熱系統的評估
-
50,000
-
-
-
宜蘭地區深層地熱資源調查及加強型地熱系統場址的評估
-
-
52,515
46,000
103-104/
98,515
李ＯＯ
7-5nm半導體技術節點研究
-
59,995
59,922
59,989
102-104/
179,906
李＃＃
加速行動寬頻服務及產業發展－災害訊息廣播平台系統建置
-
-
-
50,090
-
林ＯＯ
地球化學貴重儀器維護、服務及管理平台計畫
31,168
-
-
-
-
林＃＃
能源國家型科技計畫台美國際合作計畫-與美國加州理工學院Caltech能源科技研究合作(熱電材料、二氧化碳捕捉與轉化、智慧電網、燃料電池、太陽能電池、生質燃料等)
52,794
53,730
54,300
-
101-103/
160,824林＊＊
獨立型微電網系統技術發展與應用
-
-
50,000
-
-
國家型科技計畫(產學合作)-開發型-獨立型微電網系統技術發展與應用
-
-
-
34,794
-
林ＶＶ
台灣二氧化碳地質封存研究暨先導試驗場建置及整合技術開發
-
32,000
-
-
-
林＋＋
台灣西南海域天然氣水合物資源台德合作探勘計劃
45,343
50,800
-
-
101-102/
96,143
台灣西南海域天然氣水合物資源台德合作探勘計畫
-
-
42,307
133,500
103-104/
175,807
林※※
基於SDN和Cloud架構之無線/寬網技術與服務
-
-
57,000
57,000
103-104/
114,000
邱ＯＯ
智慧電網與讀表主軸專案計畫－微電網先導型計畫
48,028
-
-
-
-
門ＯＯ
智慧電網與讀表主軸專案計畫－微電網先導型計畫
-
50,000
-
-
-
洪ＯＯ
新穎抗糖尿病候選藥物DBPR211之臨床前研發
-
-
52,498
-
-
徐ＯＯ
以EGFR為分子標靶之抗肺腺癌新穎候選藥物DBPR112之臨床前及臨床試驗研發
45,000
61,461
-
43,141
101、102、104/
149,602
張Ｏ
跨國頂尖研究中心-國際頂尖異質整合綠色電子研究中心
-
35,000
32,000
32,000
102-104/
99,000
梁ＯＯ
新世代跨領域科學人才培育計畫
-
64,848
42,000
38,590
102-104/
145,438
許ＯＯ
跨國頂尖研究中心-Intel-台大創新研發中心
36,500
40,000
36,500
-
100-103/
153,000
許＃＃
智慧電子國家型科技計畫-MG+4C垂直整合推動專案計畫
-
-
-
46,429
-
陳ＯＯ
前瞻下世代行動通訊終端關鍵技術研究
-
-
74,554
75,970
103-104/
150,524
陳＃＃
智慧電網主軸專案計畫-先進配電自動化先導型計畫
40,000
33,546
-
-
99、101、102/
103,545
澎湖智慧電網技術展示計畫
-
-
32,943
-
-
陳＊＊
國家型科技計畫(產學合作)-開發型-瓩級黑潮發電先導機組研發與實海域測試平台建置規劃
-
-
-
75,000
-
賀ＯＯ
Atacama大型毫米/次毫米陣列-台灣計畫
84,940
87,600
-
-
99-102/
335,050
Atacama大型毫米/次毫米陣列-台灣計畫
-
-
72,844
68,408
103-104/
141,252
黃ＯＯ
次世代鋼及其綠色製程與產品創新應用產學合作計畫
-
64,999
64,000
64,997
102-104/
193,996
黃＃＃
核能技術主軸專案計畫-核能電廠地震危害度評估及結構設計分析與驗證技術建立(2/3)
34,631
-
-
-
-
核能安全-核能電廠地震危害度評估及結構設計分析與驗證技術建立(2/2)
-
34,631
-
-
-
楊ＯＯ
需量反應、分散式電源與儲能之整合應用
-
-
31,530
-
-
楊＃＃
跨國頂尖研究中心-跨國頂尖癌症研究中心
35,000
35,000
35,000
35,000
101-104/
140,000
楊＊＊
台灣中北部沿海地區CO2封存技術及注儲先導試驗
-
-
36,000
-
-
談ＯＯ
以再生原料為基礎之新世代綠色化工技術
-
-
60,000
60,000
103-104/
120,000
鄭ＯＯ
超穎材料奈米薄膜特性及光電應用
-
50,000
50,000
50,000
102-104/
150,000
謝ＯＯ
人類疾病誘導型多潛能幹細胞服務聯盟I
-
-
-
30,189
-
謝＃＃
抗癌多靶點激酶抑制劑DBPR114之臨床前研究及備選藥物之開發
-
-
36,946
39,224
103-104/
76,170
羅ＯＯ
食糧危機：以蝦類養殖為模式建構科學化永續水產養殖產業
-
-
32,500
32,500
103-104/
65,000
龔ＯＯ
建立「生物老化新觀念」進而發展「成功老化新策略」
-
-
32,212
-
-
※註：1.資料來源，科技部提供，本報告整理。
2.本表係請科技部篩選101年度至104年度任一年度單一計畫補助金額超過3,000萬元之各年期經費。
3.末欄多年期計畫之資料僅供參考，所列多年期計畫原則以科技部之計畫編號認定，倘計畫名稱相同，連續年度列有(I)(II)(III)期等，亦列為多年期計畫。多年期計畫係分年核定經費，未來年度經費尚待核定，因此本表呈現之合計經費僅能加總至104 年度以前之經費。
4.同姓氏之主持人以ＯＯ、＃＃等不同符號代表以茲區別。
(三)主持計畫件數多者不必然取得較多之補助經費，除計畫件數外，允宜將補助金額併同納入考量
科技部訂定補助單一計畫主持人計畫件數核給基準，係為使資源合理分配，並顧及單一計畫主持人從事研究工作之負荷，然計畫補助金額低至數十萬元，高至逾億元，工作負荷難以併論，所獲得之資源亦差距甚大，因此，單以計畫件數論，恐失之偏頗。
以104年度為例，單一計畫主持人計畫件數及金額偏高者人數相去不遠，補助4件以上有22人，補助超過3,000萬元有25人，然補助4件以上者多為補助501萬元至1,000萬元，而補助超過3,000萬元者則多為補助1件計畫，同時補助4件以上且超過3,000萬元者僅有1人(附表4-5)。復觀察104年度主持件數及金額最高之主持人，主持5件計畫者受補助金額為1,735萬餘元，受補助金額逾億元者僅主持1件計畫，計畫件數多者不必然取得較多之補助資源。因此，倘考量資源分配之公平性及主持人之工作負荷，補助單一計畫主持人之限制，除計畫件數外，允宜將金額併同納入考量。
附表4-5：104年度單一計畫主持人計畫件數及金額偏高之人數交叉分布情形
單位：人
4件及5件
超過3,000萬元
100萬元以下
0
1件
11
101萬元至500萬元
4
2件
7
501萬元至1,000萬元
11
3件
6
1,001萬元至3,000萬元
6
4件
1
3,001萬元至5,000萬元
1
合計
25
5,001萬元至1億元
0
1億元以上
0
合計
22
※註：1.資料來源，科技部提供，本報告整理。
綜上，科技部補助學術研究經費年約2百億元，集中於特定學校機關，專題研究計畫加計國家型科技計畫之補助經費，前3大執行機構合計近3成，前10大執行機構合計逾5成；此外，無論計畫件數或補助金額，均有集中資源於部分主持人之情事，允宜檢討資源分配之妥適性。