中央政府各主管機關函送財團法人105年度預算案、營運及資金運用計畫至立法院者合計165家，以經濟部所轄40家財團法人為最多，農委會所轄30家財團法人次之；165家財團法人接受政府補助與委辦收入103年度決算數總計為483.75億元、104年度決算數494.46億元，105年度預算數483.03億元，其中以經濟部所轄財團法人之金額為最高，103年度決算數299.45億元、104年度決算數309.26億元，105年度預算數293.02億元，占165家財團法人接受政府補助與委辦金額之6成以上；其次為科技部所轄財團法人，103年度決算數74.10億元、104年度決算數70.95億元、105年度預算數75.43億元(詳附表2.1)。
部分主管機關所轄財團法人無需仰賴政府補助或委辦收入挹注財源，主要係因部分財團法人依法規命令設置，業務範圍以執行特定任務或公權力，並以特別公課為收入來源，例如金管會所轄財團法人保險安定基金、證券投資人及期貨交易人保護中心、保險事業發展中心、住宅地震保險基金及汽車交通事故特別補償基金等5家；或部分財團法人由政府捐助財產之孳息作為營運經費來源，例如行政院(國防部代管)所轄國防工業發展基金會依設置條例於68年成立時，政府捐助50億元(104年底政府累計捐助123.47億元)，每年度營運經費即可由財務收入支應。爰若加計財團法人代行政府業務之收入，則政府對財團法人之財政資源挹注將更為可觀。
附表2.1：中央政府各主管機關所轄財團法人一覽表
單位：家數；新臺幣億元
主管機關
所轄財團法人家數
政府補助與委辦收入
103年度決算數
104年度決算數
105年度預算數
行政院(國防部代管)
1
0
0
0
內政部
8
1.86
1.87
2.04
文化部
14
27.33
26.80
24.78
外交部
3
11.44
13.58
13.00
交通部
12
0.41
0.47
0.55
法務部
3
0.53
0.84
2.85
金管會
9
0.19
0.21
0.02
原能會
3
0.07
0.03
0.01
科技部
3
74.10
70.95
75.43
教育部
14
1.16
1.21
1.11
陸委會
2
1.95
1.90
1.86
經濟部
40
299.45
309.26
293.02
農委會
30
17.55
17.57
16.33
僑委會
2
0.20
0
0
衛福部
16
34.97
35.61
36.10
環保署
2
0.90
0.89
0.99
司法院
1
8.78
9.60
10.99
原民會
1
2.52
3.17
3.31
通傳會
1
0.32
0.46
0.61
蒙藏會
1
0.02
0.02
0.03
退輔會
1
0
0
0
合計
165
483.75
494.46
483.03
※註：1.資料來源，各主管部會彙整之財團法人填報資料，本研究彙整。
2.因四捨五入關係，或有尾差。
3.105年度新增交通部所轄財團法人台灣海峽兩岸航運協會及財團法人中國驗船中心等2家，以及衛福部所轄財團法人寄生蟲防治會及財團法人微窗醫學基金會等2家送營運及資金運用計畫。
4.經濟部所轄財團法人台灣糖業協會、以及教育部所轄財團法人中興工程科技研究發展基金會，主管機關認定為政府捐助之財團法人並主動提供資料，故納入本報告研究範圍。