中長程個案計畫允宜訂定績效指標、衡量標準及指標值，惟部分生技(醫)園區計畫未訂有相關內容，分述如下：

(一)中長程個案計畫允宜設定績效指標、衡量標準及目標值，跨機關性質者允宜訂定跨機關績效指標

中長程個案計畫編審要點(以下簡稱編審要點)第5點第1項第2款規定：「中長程個案計畫內容如下：…(二)計畫目標…3.績效指標、衡量標準及目標值。」第3項第1款規定：「各機關依據中長程個案計畫之性質及需要，就下列事項擬訂相關內容：(一)中長程個案計畫屬跨機關性質者，應於第1項第2款，訂定跨機關績效指標。…。」

(二)部分中長期個案計畫，未訂定跨機關或個別機關之績效指標

1.國家生技研究園區計畫訂定跨機關、個別機關之績效指標

國家生技研究園區訂有「總體績效指標」及「個別績效指標」；「總體績效指標」分成「直接效益」、「間接效益」及「學術研究」，「直接效益」包括租金收入及管理費收入，「間接效益」包含興建期間、營運期間及研發帶動之國內生產毛額效益，「學術研究」則包括世界性領域、論文發表、技術移轉授權及研究團隊養成等；「個別績效指標」區分為「國家實驗動物中心」、「生物技術開發中心」、「衛生福利部食品藥物管理署」及「中央研究院」等進駐機關(單位)之績效指標。

2.新竹生物醫學園區計畫未訂跨機關績效指標，且部分機關未訂個別績效指標

新竹生物醫學園區計畫，僅生醫科技與產品研發中心設有專業團隊之養成等14項績效指標；新竹生醫園區分院、產業及育成中心均未訂定個別績效指標；再者，新竹生物醫學園區計畫為涉及科技部、教育部、經濟部之跨部會計畫，允宜依據編審要點訂定跨機關之績效指標。

(三)部分計畫定有績效指標，卻無衡量標準及目標值

新竹生物醫學園區計畫之生醫科技與產品研發中心，定有績效指標，如專業團隊之養成、博碩士之培育、研究報告、辦理產學交流活動、專利產出、技術報告、技術移轉、規範標準之制定、促成廠商投資、創新產業或模式、協助提升我國產業地位、創業育成、服務平台建立及增加就業等14項，惟均未訂定衡量標準及目標值，難以落實績效評估作業。

綜上，部分中長期個案計畫未訂定個別或跨機關之績效指標，或未訂定衡量標準、指標值。