行政院所屬各機關個案計畫管制評核作業要點第4點第4項前段規定：「屬跨機關執行之政院管制計畫，主辦機關應負組織、協調、統合及控制之責，協同相關機關推動，並應成立專案小組強化管理。」惟科技部為新竹生物醫學園區計畫之主辦機關，卻未依規定成立指導小組及執行小組以落實計畫之監督及執行。爰此，計畫之主辦機關允宜善盡督導及協調整合之職責，並強化計畫之管理，以利計畫之執行。