就業基金自79年開辦以來，各縣市不論在就業基金規模、可收取之差額補助費收入及身障者促進就業業務支出等均差異頗大，以106年度為例，全國差額補助費收入85.4%集中於6都，全國身障者促進就業業務支出有83.37%係供6都及北部地區縣市支用，可悉直轄市及北部地區縣市所分配之資源遠高於中部、南部、東部及離島等地區。各縣市政府每年雖已提撥30%差額補助費收入撥交中央統籌分配，惟仍未能有效平衡城鄉差距。

直轄市及都會型縣市無論在身障人口數、義務機關數、就業基金餘額及應提撥總額等，原就遠高於非都會型縣市，依身心障礙者就業基金撥交就業安定基金提撥及分配辦法第4條附表所定公式計算而得之分配款項，實難補足低資源縣市之所需。政府允宜研議更適切之就業基金提撥比率與統籌款分配計算公式，以改善城鄉資源分配不均之現象。