近3年度(104~106年)中央政府各主管機關為配合政府產業扶持政策或事業本身營運發生虧損等因素，致增減部分投資事業(詳附表3)。新增投資部分，如國發基金105年及106年基於協助產業轉型升級，投資Gogoro公司(10.03億元，持股4.74%)、如興公司(14.88億元，持股9.30%)、台杉投資管理顧問公司(0.5億元，持股39.68%)、台杉水牛投資公司(8億元，持股34.41%)及陽明海運公司(48.99億元，持股19.80%)等企業；交通部透過主管高速鐵路相關建設基金於104年投資台灣高速鐵路公司(254.79億元，持股43.00%)，及臺灣港務公司106年投資陽明海運公司(14.34億元，持股5.14%)；經濟部主管中油公司為拓展國際市場，於104年投資宏越責任有限公司(5.80億元，持股40%)。
減少投資部分，如經濟部主管之台糖公司因考量動物用藥市場萎縮，評估後決定出售投資事業-碩騰生技公司股權，並於105年4月29日與買方（永信藥品公司）完成交割，出售所有股份並認列投資利益4,228萬元；另原投資生技創投事業-生物科技發展基金-BDF因累計獲配現金已全數收回投資成本6億7,620萬元，基金並已進入投資尾期，團隊評估後決議結清並進行清算。以及經濟部主管推廣貿易基金投資之智玖創業投資公司於104年至106年間因不堪虧損，陸續辦理減資乃至最後決議進行清算解散，該基金獲得退回投資資金1,400萬元；退輔會投資之榮民製藥公司因虧損多年，陳報行政院核定撤資。
附表3：近3年度(104~106年)中央政府各主管機關(含所屬)轉投資 民營事業之增(減)概況表
主管機關
投資單位
年度
增（減）投資事業
政府挹注（收回）資金
行政院國發基金
行政院國發基金
105
Gogoro Inc.
10.03億元
106
陽明海運(股)公司
48.99億元
如興(股)公司
14.88億元
台杉投資管理顧問(股)公司
0.5億元
台杉水牛投資(股)公司
8億元
財政部
臺灣銀行
104
原投資臺灣人壽保險(股)公司股份與中國信託金融控股(股)公司完成股份轉換成為子公司
-
經濟部
中油公司
104
宏越責任有限公司
5.80億元
台糖公司
105
(碩騰生技股份有限公司)
0.42億元
106
(生物科技發展基金-BDF)
6.76億元
推廣貿易基
104~106
(智玖創業投資股份有限公司)
0.14億元
交通部
臺灣港務公司
106
陽明海運(股)公司
14.34億元
高速鐵路相關建設基金
104
台灣高速鐵路股份有限公司
254.79億元
退輔會
退輔會
106
(榮民製藥公司)
陳報行政院核定撤資
※註：1.資料來源，各主管機關；本報告整理製表。