中研院111年度預算案「南部院區」工作計畫項下「院區維運及興建工程」編列9億4,105萬9千元，其中公共建設及設施費8億5,420萬元為「南部院區綜合規劃」及「發展量子科技及興建實驗大樓規劃」之工程經費，謹說明如下：
(一)南部院區為發展量子科技研究，將於第II研究大樓設置量子實驗室並興建量子實驗大樓
106年7月14日行政院核定中研院「南部院區綜合規劃」，總經費55億4,541萬7千元(用地取得15億4,500萬元、先期規劃階段作業費1億1,217萬6千元及建造工程費38億8,824萬1千元)，計畫期程自105年度至110年度。嗣後因工程標案多次流標及缺工缺料問題，行政院於109年9月2日核定修正計畫，將計畫期程由110年度展延至111年度。110年中研院為加速啟動量子科技研究，規劃在第II研究大樓設置量子實驗室，經行政院110年7月21日同意該計畫增加裝修工程經費1億2,242萬5千元，計畫總經費調增為56億6,784萬2千元，並展延計畫期程至113年3月。
另中研院南部院區為打造量子科技發展場域，形成周邊群聚效應，以加速發展量子科技，規劃興建量子實驗大樓，行政院於110年7月16日同意中研院函報之「發展量子科技及興建實驗大樓規劃」，總經費17億8,813萬3千元(包含工程經費9億3,813萬3千元及量子科技儀器設備費8億5,000萬元)，計畫期程自111年度至115年度。
(二)第II、III研究大樓主體工程允宜持續管控進度，俾利如期如質於111年竣工
「南部院區綜合規劃」總經費56億6,784萬2千元，截至110年度已編列預算數45億8,406萬1千元，迄同年8月底累計執行數36億2,446萬8千元(累計預算執行率79.07%)(詳表1)。「南部院區綜合規劃」採分階段開發，第一階段興建公共工程及第I研究大樓，第二階段興建第II、III研究大樓。第一階段興建工程已於109年9月竣工，109年12月取得使用執照，110年1月驗收，農業生技專題中心已於109年底搬遷進駐，並且陸續有研究團隊進駐。第二階段興建工程，109年2月決標、109年3月開工、109年底進行地下室結構工程施工，預計111年9月竣工(詳表2)。
鑑於「南部院區綜合規劃」，因缺工缺料問題導致計畫進度落後，爰辦理第1次修正計畫並展延計畫期程至111年，又為設置量子實驗室辦理第2次修正計畫並展延計畫期程至113年3月。惟設置量子實驗室僅影響第II研究大樓之內部裝修，未影響大樓主體工程進行，爰此，中研院允宜持續管控工程進度，俾利第II、III研究大樓之主體工程如期如質於111年竣工。
綜上，南部院區為發展量子科技研究，將於第II研究大樓設置量子實驗室並興建量子實驗大樓，惟「南部院區綜合規劃」已二度辦理計畫修正並展延計畫期程至113年3月，允宜持續管控工程進度，俾利第II、III研究大樓興建工程如期如質於111年竣工。
表1 105至110年度「南部院區綜合規劃」之預算執行表
單位：新臺幣千元
年度
可支用預算數
執行數
以前年度
本年度
合計
實現數
應付數
賸餘數
合 計
105
0
88,000
88,000
88,000
0
0
88,000
106
0
1,487,000
1,487,000
1,461,831
0
0
1,461,831
107
25,169
246,014
271,183
69,938
0
0
69,938
108
201,245
1,090,450
1,291,695
368,338
0
0
368,338
109
923,356
986,961
1,910,317
1,353,285
0
0
1,353,285
110
557,032
685,636
1,242,668
283,076
0
0
283,076
合計
-
4,584,061
-
3,624,468
0
0
3,624,468
說 明：110年度為截至8月底執行數。
資料來源：中研院提供。
表2 「南部院區綜合規劃」之計畫期程與實際期程表
計畫階段
工作項目
細部工程
第2次修正之計畫期程(年.月)
實際期程
(年.月)
第一階段
E區整體規劃及第I研究大樓建築設計
完成招標
106.09
106.09
完成設計
107.06
107.06
第I研究大樓興建工程
完成招標
107.10
107.10
竣 工
109.09
109.09
第二階段
第II、III研究大樓建築設計
完成招標
107.11
107.11
完成設計
108.10
108.07
第II、III研究大樓興建工程
完成招標
109.02
109.02
竣 工
111.09
-
第II研究大樓量子實驗室
完成設計
111.12
-
完 工
113.03
-
資料來源：中研院提供。