為維持我國之口蹄疫非疫區、推動清除豬瘟政策及其他重要疫病防控，維護養豬產業生產環境安全，防檢局自111年起辦理「豬瘟撲滅及防範重要豬病防檢疫計畫」，並於「動植物防檢疫管理－動物防疫業務」計畫項下編列獎補助費8,886萬元，補助各地方政府及其他中央機關辦理重大豬隻疫病監測、防疫物資整備及相關防疫工作等。謹說明如次：
(一)我國豬隻生產量值占畜產品4成以上，為利養豬產業永續發展及爭取國際貿易空間，防檢局辦理豬瘟撲滅及防範重要豬病防檢疫計畫
依據109年度農業統計要覽之主要農林漁牧產品生產量及農林漁牧產品生產值，豬隻為畜產品生產量最高(109年度達84萬3,856公噸)，豬隻生產值(714億8,734萬元)占畜產品生產值(1,688億1,338萬7千元)42.35%，為使養豬產業永續發展，並拓展其國際貿易空間，行政院110年8月間核定豬瘟撲滅及防範重要豬病防檢疫計畫，主要內容如下：
1.執行期間為111至114年度。
2.計畫所需經費為12億3,157萬4千元(中央公務預算計12億1,122萬4千元)。
3.工作項目為維持口蹄疫非疫區防檢疫工作(3億3,383萬6千元，中央政府3億2,740萬元)、豬瘟撲滅工作(7億5,273萬8千元，中央政府7億3,882萬4千元)及國內重要豬病防控工作(1億4,500萬元，全數由中央政府編列)。
(二)防檢局106至110年度共投入4億餘元經費執行撲滅口蹄疫相關計畫，我國臺灣本島、澎湖及馬祖於109年6月間始列為不施打疫苗口蹄疫非疫區
我國毛豬產量、產值及肉類貿易曾於85年度達1,431萬頭，產值886億元，為稻米產值2.3倍，居國內農業單項產值首位，且供應外銷之毛豬屠宰頭數686萬，豬肉外銷量27萬公噸，創造外匯達562億元，然因86年口蹄疫爆發，造成我國豬肉產業巨大損失，且喪失豬肉外銷市場。
為撲滅口蹄疫疫情，政府陸續辦理各項防疫工作，查防檢局106至110年度編列與撲滅口蹄疫相關之計畫(詳表1)，主要為「養豬產業振興發展計畫-撲滅口蹄疫」及「口蹄疫撲滅計畫」(其中口蹄疫撲滅計畫110年度屆期，仍在執行中)，預算經費共4億2,082萬3千元(截至110年8月底執行數合計為3億5,530萬元)，至109年6月間世界動物衛生組織(簡稱OIE)始認定我國臺灣本島、澎湖及馬祖為不施打疫苗口蹄疫非疫區。
表1 「養豬產業振興發展計畫-撲滅口蹄疫」及「口蹄疫撲滅計畫」預算編列及執行情形 單位：新臺幣千元
計畫名稱
執行
期間
預算數
決算數
辦理事項
養豬產業振興發展計畫-撲滅口蹄疫
106-109
97,000
97,000
1.落實口蹄疫苗注射及運豬車輛隻臨床檢查
2.強化運輸車輛清洗消毒防疫輔導及查核
3.偶蹄類動物畜牧場生安全輔導及查核
4.蒐集及彙整防疫資料向世界動物衛生組織申請口蹄疫非疫區
5.向OIE申請口蹄疫非疫區期程
口蹄疫撲滅計畫
107-110
323,823
258,300
1.落實畜養業者主動通報疫情，推動口蹄疫疫苗注射
2.強化口蹄疫查核監測與疑似案例管制及防治
3.強化運輸車輛清洗消毒防疫輔導及查核
4.輔導畜牧場落實生物安全工作，強化自衛防疫措施。
5.強化公務機關聯繫及檢討各項防疫措施
6.儲備口蹄疫緊急儲備疫苗、抗原銀行及消毒防疫物資
7.強化國內動物疫病流行病學調查、預警及通報系統
8.蒐集及彙整相關資料以向OIE申請成為口蹄疫非疫區
9.強化邊境管制，及離島動物移動管制措施
合計
420,823
355,300
資料來源：防檢局提供及摘錄自「養豬產業振興發展計畫-撲滅口蹄疫」及「口蹄疫撲滅計畫」核定本。
(三)雖我國近年已無口蹄疫及豬瘟疫情發生，惟國際豬隻相關疫病仍頻，允宜持續監控，以利產業發展
另檢視97至109年度我國口蹄疫及豬瘟疫情概況(詳表2)，其中豬瘟無染疫情形，每年度均需注射疫苗，口蹄疫於98年曾嘗試全面停止施打疫苗，然後續出現口蹄疫案例，故再度預防注射疫苗，直至103年後始無疫情發生，臺灣本島、澎湖及馬祖並於108年正式拔針，目前僅剩金門縣持續施打疫苗。
表1 97年度至109年度我國口蹄疫及豬瘟疫情概況 單位：頭
年度
豬瘟
口蹄疫
預防注射
患畜
死亡
撲殺
預防注射
患畜
死亡
撲殺
97
14,067,609
-
-
-
6,231,148
-
-
-
98
12,841,253
-
-
-
3,404,327
-
-
-
99
14,567,806
-
-
-
8,232,390
139
-
169
100
15,706,660
-
-
-
9,001,280
1,215
-
2,021
101
16,511,214
-
-
-
9,219,625
795
-
1,249
102
15,970,592
-
-
-
8,375,185
26
-
-
103
15,594,703
-
-
-
7,952,787
-
-
-
104
14,945,816
-
-
-
7,993,918
-
-
-
105
15,064,248
-
-
-
8,201,911
-
-
-
106
14,762,576
-
-
-
7,968,171
-
-
-
107
14,113,485
-
-
-
3,499,039
-
-
-
108
14,059,297
-
-
-
27,108
-
-
-
109
14,714,345
-
-
-
29,415
-
-
-
資料來源：整理自防檢局101至109年度統計年報。
鑒於目前國際口蹄疫疫情仍未遏止，依據防檢局110年9月22日公告之動物傳染病非疫區及疫區之國家(地區)，亞洲僅有日本及新加坡，顯示口蹄疫仍於多國持續發生，允應積極防範疫情再起，且國際另有許多豬隻疫病發生(如豬流行性下痢等)，部分亦可能有人畜共通豬病，允宜持續監測及建立預警機制；又按豬瘟撲滅及防範重要豬病防檢疫計畫核定本指出，雖我國已多年未傳出豬瘟確診案例，惟停止施打豬瘟疫苗前尚需確認環境中是否殘存病原，相關野豬族群調查及監測亦需符合OIE規範，為提升養豬產業國際競爭力及拓展國外市場，允宜謹慎規劃並與產業溝通協調。
綜上，我國臺灣本島、澎湖及馬祖於109年6月間被OIE認定為不施打疫苗口蹄疫非疫區，然因國際間口蹄疫疫情仍持續發生，且為求拓展國外市場，亦需謹慎評估豬瘟疫苗拔針可行性，防檢局自111年度編列預算辦理豬瘟撲滅及防範重要豬病防檢疫計畫，為確保養豬產業不再受到口蹄疫或其他豬隻疫病之入侵，允宜持續監測並加強各項防疫措施。