離島建設基金111年度預計短絀8億9,759萬6千元，較110年度預算增加短絀411萬4千元，增幅0.46%。經查：
(一)基金來源主要係國庫撥款收入
為加速離島建設，於90年度成立離島基金，預計至111年度止，基金來源總額313億9,059萬3千元，主要收入係國庫撥款收入300億元，占比95.57%，其次為利息收入-基金孳息8億6,578萬5千元及雜項收入（主要係收回補助計畫結餘款）4億6,361萬6千元，占比分別為2.76%及1.48%，其他各項收入占比均微（詳表1）。
表1 離島基金歷年基金來源明細表 單位：新臺幣千元
年度
國庫撥款
收入
利息收入－
基金孳息
雜項收入
違約罰款
收入
利息收入－
貸款
合計
90-99
30,000,000
466,276
390,556
22,049
6
30,878,887
100
0
74,106
25,739
0
4
99,849
101
0
71,677
6,199
6,632
3
84,511
102
0
66,019
6,521
2,471
3
75,014
103
0
58,165
2,442
10,025
2
70,634
104
0
47,594
1,556
4,381
2
53,533
105
0
35,623
4,500
9,803
2
49,928
106
0
26,673
5,075
713
1
32,462
107
0
18,143
752
976
0
19,871
108
0
798
356
3,892
0
5,046
109
0
221
2,350
1,369
0
3,940
110
0
190
6,640
0
64
6,894
111
0
120
6,640
0
64
6,824
合計
30,000,000
865,605
459,326
62,311
151
31,387,393
說 明：109年度以前為決算數，110及111年度為預算案數。
資料來源：離島基金提供資料及111年度預算書。
(二)離島基金連年短絀，111年底預計基金餘額僅餘7.5億元
國庫依離島建設條例於90至99年度撥足基金額度300億元，自100年度起不再撥補，離島基金之基金來源逐年減少，無法支應各項業務計畫所需經費，致連年發生短絀，基金餘額由100年度97億4,781萬3千元逐年縮減，預計至111年底基金餘額僅餘7億4,939萬5千元（詳表2）。
表2 離島基金100年至111年基金來源、用途及餘絀一覽表
單位：新臺幣千元
年度
基金來源
基金用途
本期賸餘(短絀-)
期末基金餘額
100
99,849
1,088,345
-988,497
9,747,813
101
84,511
965,491
-880,980
8,866,832
102
75,014
1,175,673
-1,100,658
7,766,174
103
70,634
892,080
-821,445
6,944,728
104
53,533
509,121
-455,588
6,489,140
105
49,928
664,419
-614,491
5,874,649
106
32,462
719,638
-687,176
5,187,473
107
19,871
806,544
-786,673
4,400,799108
5,046
759,436
-754,391
3,646,409
109
3,940
718,542
-714,602
2,931,807
110
6,894
900,376
-893,482
1,859,624
111
6,824
904,420
-897,596
749,395
說 明：109年度以前為決算數，110及111年度為預算案數。
資料來源：離島基金歷年預、決算書。
(三)以現行收支水準估算，離島基金112年即將用罄
倘未來國庫不再撥補，以離島基金109年度決算、110年度預算及111年度預算案之基金來源平均數0.07億元，估列未來年度收入，並以同期間基金用途平均數約9.02億元，估計未來支出水準，收支相抵後，估算平均年度短絀約8.95億元，以111年底預估基金餘額7.49億元，112年即將用罄，據該基金說明：與行政院主計總處業已初步達成共識，預計於112年依照離島建設需求，核實由國庫撥補離島建設基金所需經費。
綜上，離島基金歷年主要財源為國庫撥款收入，自100年度起不再撥補後，基金來源逐年銳減，連年發生短絀，111年底預計基金餘額尚不足8億元，以目前收支水準估算，離島基金於112年即將用罄，為推動離島建設，使該基金永續發展，允宜儘速妥為規劃因應。