近年來經濟部隨著治水業務量鉅增，除編列年度公務預算、作業基金預算及營業基金預算外，另配合政府政策編列易淹水地區水患治理計畫、流域綜合治理計畫、前瞻計畫等多項特別預算；經統計91至106年度經濟部所投入之各項治水與水資源開發等水環境建設經費已高達7,207.38億元，107年度續編列計畫所需預算424.00億元，合共7,631.38 億元(詳附表1)，除使預算規模日趨龐大，同時亦增加執行上之挑戰性。
附表1：經濟部及所屬91至107年度投入水環境建設經費統計表
單位：新台幣億元
年度
公務預算
(1)
追加預算
(2)
特別預算
(3)
營業與非營業基金(4)
水環境建設預算總規模(5)=
(1)+(2)+(3)+(4)
91
208.05
12.00
0.00
107.34
327.39
92
146.37
27.88
0.00
94.93
269.18
93
132.57
57.00
0.00
70.30
259.87
94
178.99
0.00
236.70
83.74
499.43
95
146.59
0.00
31.67
113.60
291.86
96
140.41
0.00
215.00
102.72
458.13
97
154.38
0.00
80.25
114.97
349.60
98
184.50
0.00
116.67
189.51
490.68
99
73.89
0.00
499.60
191.09
764.58
100
65.27
0.00
526.86
164.28
756.41
101
133.72
0.00
173.88
161.84
469.44
102
130.35
0.00
282.96
148.29
561.60
103
140.16
0.00
13.39
197.92
351.47
104
126.31
0.00
73.49
185.50
385.30
105
123.55
0.00
115.08
174.28
412.91
106
111.09
0.00
216.80
231.64
559.53
107
127.69
0.00
94.23
202.08
424.00
小計
2,323.89
96.88
2,676.58
2,534.03
7,631.38
※註：1.資料來源，各機關單位提供。本表調查對象包括：經濟部水利署、水資源作業基金及台水公司。
2.本表91-105年度為審定決算數，106年度為法定預算或預算案數，107年度為概算數；另流域綜合治理計畫105-106年度為法定預算數，前瞻計畫106-107年度為概算數。