水環境建設計畫106至113年度預計編列特別預算2,507.73億元，其中水源開發與利用計有17項計畫，經費1,076.43億元，占42.92%，重大項目經費運用情形，檢討如下：
(一)石門水庫防淤缺乏長遠規劃，導致泥砂嚴重淤積
1.水庫規劃興建時，未積極規劃相關防淤措施：石門水庫初始規劃設計估算之年泥砂淤積量僅80萬立方公尺，惟自53年6月30日竣工起營運迄今，歷經數次極端颱洪事件後，水庫總容量已從原設計3.09億立方公尺減少為2.17億立方公尺，究其原因主要係水庫規劃興建時未能將強降雨氣候異常情形及陡峻山區易沖刷泥沙情況納入考量，致在水庫功能上未予積極規劃設置相關因應(應變)措施(如防洪防淤隧道等)，整體防淤能力仍顯不足(詳附錄之附圖1)。
2.原規劃設計目標不易達成：石門水庫原無排砂設施設計，僅於「石門水庫及其集水區整治計畫」將既有水利設施進行防淤更新改善，原預估電廠鋼管改造為排砂隧道後每年可增加排砂量100萬立方公尺；惟電廠排砂隧道自102年完工迄今僅排砂4次、排砂量309.4萬立方公尺，除102、104年度外，多未達成原設計目標(詳附表6)，主要係電廠排砂隧道僅能利用颱洪期間水量進行水力排砂操作，藉由水庫異重流到達時將高濃度泥流排放至水庫下游河道，減少水庫泥砂淤積等因素所致，亟待加強防淤設施完工後之營運、管理，以澈底解決水庫淤積量逐年增加問題。
附表6：石門水庫101-105年度淤積處理概況表 單位：萬立方公尺
年 度
陸挖
抽泥
水力排砂
小計
101
36.7
24.8
-
61.5
102
30.5
32.6
100.6
163.7
103
49.2
37.7
0
86.9
104
77.7
58.3
138.8
274.8
105
72.9
31.8
70.0
174.7
平均值
53.4
37.04
77.35
167.8
※註：1.資料來源，經濟部水利署提供。本表「水力排砂」係指電廠排砂管及永久河道放水口(pro)水力排砂量。
(二)烏溪鳥嘴潭人工湖計畫用地取得與工程發包作業縮短，時程將更為緊迫，恐影響施工進度
烏溪鳥嘴潭人工湖計畫總經費199億元，期程自104至112年止，需用地面積約292萬平方公尺；由於本計畫範圍內土地約有60%為私有地，相關協議價購、分區變更及徵收作業時間冗長，原預定於計畫核定後第4年(即107年底)始能完成用地取得作業，故106年度僅編列用地取得先期規劃作業費0.9億元，辦理用地取得先期作業及非都市土地分區變更作業，107年度再辦理用地取得及施工。
嗣因本案提報列入前瞻計畫，原規劃用地取得作業與計畫期程分別提前至106年底及111年完成，故於106年度新增編列用地取得費用72.5億元，並以106年底前完成全部用地取得、107年1月1日施工為目標。惟本案原預訂於105年9月30日前辦理2場公聽會，因綜合規劃作業延宕，遲至106年3月2日始完成，同年4月5日雖已完成烏溪鳥嘴潭人工湖工程計畫興辦事業計畫書，但後續尚有完成開發計畫非都市土地分區變更等多項作業程序尚待踐行(詳附錄之附圖2及附表13)，而距行政院核定計畫用地取得作業完成期限(106年底)，僅剩6個月餘，時程頗為緊迫，如無法順利取得用地，恐影響後續工程發包作業進行。
(三)深層海水資源利用及產業發展實施計畫之取水設施於完成驗收後，即發生供水中斷異常情形，效能頗為不彰
1.先期規劃設計不周：為促進經濟發展及地方就業，經濟部及農委會前於94年度研擬推動深層海水資源利用及產業發展實施計畫(第1期實施計畫)，總經費18.732億元，執行期程95年至98年；執行期間「深層海水低溫利用及取水隔熱新工法研發模廠計畫」、「協助地方政府加速推動深層海水產業」及「深層海水檢測驗證技術研發及制度建立」等工作項目內容大幅變動，提報第1次修正計畫，總經費調增為20.423億元。修正後再因「深層海水低溫利用及取水隔熱新工法研發模廠計畫」、「籌建國家水產生物種原庫計畫-臺東支庫」等工作項目內容大幅變動，續提出第2次修正計畫，總經費大幅調增為23.125億元，期程則展延至100年底，顯示本案規劃設計未臻周延，導致執行過程，常須反覆檢討或修正計畫，延宕計畫推動期程。
2.供水效能不彰：第1期實施計畫中經濟部水利署所規劃興建「臺東深層海水低溫利用及多目標技術研發模廠」(總經費4.435億元)，已於100年12月3日竣工，101年3月完成驗收，101年5月2日正式移交經濟部技術處負責管理，並更名為「經濟部東部深層海水創新研發中心」；惟該中心取水設施甫完成驗收後啟用營運，101年5月6日旋即發生取水異常，導致供水中斷，迄今仍無法恢復供水，主要係規劃設計階段工址調查及資料蒐集皆未臻周妥等因素所致，嚴重影響供水效益。
(四)水庫集水區淤積與優氧化問題嚴重，宜有前瞻規劃思維與多元化策略
1.重大災害事件後崩塌嚴重：截至104年8月底止，水庫集水區國有林崩塌面積已高達5,619公頃，如以平均每年復育面積僅35公頃換算，澈底完成治理需160年；另山坡地崩塌地面積亦有逐年擴大趨勢，由95年之2萬8,900.6公頃，逐年上升至104年之3萬9,244.4公頃，增加1萬0,343.8公頃，增幅35.79%，宜及早規劃長期因應策略。
2.水庫淤積嚴重：全台主要水庫設計總容量約28.62億立方公尺，惟截至106年3月底止，有效容量20.39億立方公尺，淤積量8.23億立方公尺，淤積率28.75%，縮短水庫使用壽命，主要係目前相關治理工程僅可減輕土砂災害，無法完全攔阻泥砂，造成水庫逐年淤積、容量減少。
3.離島水庫水質優養化比率偏高：依據環保署105年度水庫水質監測資料，本島20座主要水庫屬優養程度者，包括石門、寶山、明德、白河、鏡面、澄清湖與鳳山等7座水庫，占35.0%。離島水庫除2座水庫為普養狀態外，其餘26座水庫皆屬於優養狀態，占92.86%，對公共用水安全形成極大威脅；其中本島水庫主要係為增加農業生產，大量使用農藥、肥料，導致水源水質污染，而離島水庫則是有家庭污水排入之可能性，影響當地居民正常生活。
4.部分已完成攔(防)砂壩淤滿，失去原有功能：國內目前所採防砂工程多以設置攔(防)砂壩為主，然因攔砂壩淤積嚴重且清淤不易，多數已完全失去攔阻砂石或調節水質、水流之功能，如石門水庫與曾文水庫建壩以來，雖已設置義興等11座大型攔砂壩，惟依現況調查結果，有10座淤滿，1座接近淤滿(詳附表7)，其中位於石門水庫上游之巴陵攔砂壩，在96年9月韋帕颱風來襲時，甚且嚴重崩潰損毀(潰壩)，失去原有攔截土砂及改善原水濁度之功能。
附表7：水庫大型攔砂壩使用現況一欄表 單位：新台幣千元；萬立方公尺
水庫
名稱
完工日期
興 建
工程費
蓄砂量(A)
淤積量(B)
淤積率(%)(B/A)
目前使
用情形
石門水庫
義興
55年12月
33,931
580.00
580.00
100.00
已淤滿
榮華
73年1月
548,200
1240.00
1240.00
100.00
已淤滿
砂崙仔
84年8月
70,630
29.40
29.40
100.00
已淤滿
玉峰
88年9月
52,600
68.10
68.10
100.00
已淤滿
秀巒
93年6月
72,506
18.82
18.82
100.00
已淤滿
曾文水庫
達邦
68年12月
113,612
239.10
239.10
100.00
已淤滿
達德安
70年6月
69,979
87.40
87.40
100.00
已淤滿
福山
74年5月
168,518
280.00
280.00
100.00
已淤滿
樂野
71年6月
145,883
282.70
282.70
100.00
已淤滿
里佳
79年6月
131,908
160.00
160.00
100.00
已淤滿
大埔
78年6月
208,629
264.15
243.56
92.21
(註2)
※註：1.資料來源，經濟部水利署提供。
2.本表大埔壩於莫拉克風災時雖已淤滿；嗣99年「曾文南化烏山頭水庫治理及穩定南部地區供水計畫」規劃辦理清淤工作，致其淤積率略有下降。
(五)無自來水地區供水改善經費雖逐年增加，惟預算執行率卻偏低，宜檢討問題癥結，研提分期分區改善目標
加強無自來水地區供水改善計畫期程106-113年，總經費130.5億元，除原已編列公務預算7億元及台水公司預算6.5億元外，另再新增106~113年特別預算117億元。經查：
1.預算執行效率欠佳：88年7月1日台灣省政府精省裁撤後，原由其編列之「台灣省基層建設計畫」經費中斷，水利署於91年起接續辦理相關計畫，其中自來水延管工程係由台水公司各區處施作，執行情形詳如附表8。經查最近7年(99-105年度)該計畫預算數分別為7億2,500萬元、8億2,400萬元、3億6,800萬元、3億3,200萬元、2億8,287萬5千元、2億6,150萬元及4億3,450萬元，執行結果決算數分別為5億7,643萬8千元、6億1,415萬9千元、2億5,289萬7千元、2億6,398萬7千元、2億5,288萬7千元、1億8,469萬2千元及2億2,039萬8千元，預算執行率分別為79.51%、74.53%、68.72%、79.51%、89.40%、70.63%及50.72%，執行率偏低原因主要係優先得以進行用戶接管區域漸次完成，民眾接水意願不高、管材廠商產能飽和及路權單位禁挖等因素所致，允應提升預算執行成效，以達成計畫預期目標。
2.宜加強宣導提高民眾接水意願：截至105年底止，台水公司供水轄區之自來水普及率92.50%，尚有49.6萬戶民眾未接飲自來水，其中非自來水系統範圍之無自來水戶約18.1萬戶、或54.1萬人，而自來水系統範圍內仍約有31.5萬戶、或約91.6萬人尚未接用自來水，數量甚高。此外，各縣市無自來水戶數量及分布範圍差距甚大，基隆市、澎湖縣及台南市等縣市無自來水戶低於1萬戶，而屏東縣無自來水戶則高達14萬戶，約占台灣本島無自來水戶1/4，允宜加強宣導提高民眾接水意願，俾利達成計畫預期目標。
附表8：93-106年度無自來水地區供水改善計畫執行情形一覽表
單位：新台幣千元；%；戶
年度
投資金額
提升普及率
增加供水戶數
預算數
決算數
差異
設計
實際
預計
實際
93
140,000.00
129,548.05
10,451.95
100.00%
32.36%
3,588
1,161
94
343,600.00
243,907.63
99,692.37
100.00%
42.53%
4,507
1,917
95
209,800.00
171,841.18
37,958.82
100.00%
82.45%
2,274
1,875
96
294,000.00
240,882.13
53,117.87
100.00%
79.20%
3,294
2,609
97
258,000.00
222,230.77
35,769.23
100.00%
72.46%
3,090
2,239
98
380,000.00
286,784.19
93,215.81
100.00%
68.21%
4,410
3,008
98
449,000.00
382,546.18
66,453.82
100.00%
70.57%
3,673
2,592
99
725,000.00
576,437.75
148,562.25
100.00%
78.58%
5,447
4,280
100
824,000.00
614,158.54
209,841.46
100.00%
62.77%
5,751
3,610
101
368,000.00
252,896.93
115,103.08
100.00%
83.83%
3,562
2,986
102
332,000.00
263,986.71
68,013.29
100.00%
76.43%
2,537
2,049
103
282,875.00
252,886.82
29,988.18
100.00%
85.42%
3,265
2,789
104
261,500.00
184,691.96
76,808.04
100.00%
82.14%
1,859
1,527
105
434,500.00
220,397.77
214,102.23
100.00%
75.32%
2,415
1,819
104(統)
1,000,000.00
374,932.23
625,067.77
100.00%
78.34%
5,817
4,557
105(統)
1,000,000.00
115,858.05
884,141.95
100.00%
69.88%
4,592
3,209
106
739,000.00
1,466.17
737,533.83
100.00%
33.24%
2,058
684
※註：1.資料來源，台水公司提供。本表「年度(統)」為中央特別統籌分配稅款。
2.106年度預算數739,000千元，其中水利署投資599,000千元，台水公司投資140,000千元；106年度決算數為截至4月底止實際數。