目前全球愛滋防治業務雖獲得初步成效，惟仍須面對眾多挑戰，聯合國曾揭示，確立在符合人權與自由之原則下，愛滋防治須以預防、治療、照顧及支持4項重點工作為主，復依世界衛生組織等所提之防治業務挑戰，其中我國可參酌部分有：防治不夠多且不夠快、未能將干預措施集中於需要人群或針對性不足、須能維持及確保應有的質與量(如藥效)、在連續過程中須能加強覆蓋面及成效以避免疫情反彈（僅維持以往作法將遇疫情反彈）等；而為面對前揭挑戰及有效辦理相關國家防治工作，其亦提出5項國家應檢討進行的方向及重點，包括：(一)基於了解本國疫情而量身訂定有效應對方案。(二)採用具效率及效能之干預措施。(三)公平地應對所有人群並提供具質量保證之服務。(四)預估需求並籌措資金以能持續提供服務。(五)加快創新以提高應對措施效益(優化各項預防、檢測、治療服務)等。另再加以強調應有效與各層組織之合作伙伴協力進行、須監測評估並問責及管控成本等。