我國愛滋防治計畫自83年至105年，業經5期23年執行，前3期計畫預估經費計18.97億元，復因修法增加支應95年度相關醫療費用12億元，另第4期及第5期決算數分別為95.08億元及98.69億元，97年度至105年度政府之健保欠費106.12億元，總投入經費約至少330.86億元。查94年度及95年度，因注射藥癮者新増罹患HIV人數遽增，而使我國愛滋疫情達到高峰，嗣因94年度起實施之減害計畫獲致初步成效，而使疫情趨緩，惟自99年起疫情再度趨增，查100年至105年本國籍HIV新增患者人數分別為1,968人、2,220人、2,243人、2,234人、2,327人、2,396人(詳附表1)，年增率則分別為10%、13%、1%、0%、4%及3%。復查101年至104年全球年度染患HIV新增數呈略下降，約自220萬人下降為210萬人左右，UNAIDS曾表達全球83個國家之HIV新病例數也已顯著下滑或未見成長等，我國愛滋疫情卻尚未能減緩，仍年有增加，相關防治成效顯屬欠佳。
復查本國籍100年至105年男男間不安全性行為新增染患HIV者(詳附表7)分占前揭年度新增數之77%、81.3%、84.5%、85.4%、83.6%及84.6%，101年至105年該危險因子新增患者之年增率分別為19.1%、5%、0.6%、2%及4.3%，係前揭我國近年愛滋疫情增加主因，是以亟須於該項最大危險因子群體中，獲得防治成效，俾避免未來愛滋疫情續呈惡化。另依衛福部引用美國疾管中心專家資料：「如果梅毒疫情上升，將導致愛滋病疫情升高。」故以101年至105年梅毒年月累積新增病例數檢視(詳附表8)，102年至105年每年新增病例成長率分別達3.9%、8.6%、6.9%及16.4%，另106年1至4月累計數較去年同期間成長10.5%，均屬大幅成長，係屬防治染患愛滋業務的重要警訊。
附表7：100年至105年不安全性行為危險因子年度新增染患HIV說明表
年度
男男間不安全性行為
異性間不安全性行為
不安全性行為合計
人數
年增率
人數
年增率
人數
年增率
100
1,515
-
318
1,833
-
101
1,805
19.1%
310
-2.5%
2,115
15.4%
102
1,896
5.0%
271
-12.6%
2,167
2.5%
103
1,907
0.6%
252
-7.0%
2,159
-0.4%
104
1,945
2.0%
261
3.6%
2,206
2.2%
105
2,028
4.3%
213
-18.4%
2,241
1.6%
※註：1.資料來源，整理疾管署愛滋統計資料。
附表8：101年以後全國梅毒本土及境外移入當年月累積新增確定病例數表
單位：人
年/月
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
總病例數
成長率
101
402
851
1,411
1,950
2,513
3,012
3,581
4,126
4,649
5,174
5,694
6,187
6,187
102
505
883
1,480
1,987
2,624
3,192
3,791
4,339
4,861
5,482
5,971
6,431
6,431
3.9%
103
493
890
1,440
2,102
2,677
3,290
3,949
4,542
5,187
5,831
6,412
6,987
6,987
8.6%
104
536
990
1,658
2,228
2,900
3,561
4,278
4,880
5,512
6,210
6,824
7,470
7,470
6.9%
105
571
1,071
1,792
2,516
3,314
4,070
4,836
5,633
6,368
7,130
7,945
8,698
8,698
16.4%
106
624
1,228
2,095
2,781
1-4月累計數較去年同期間累計數
10.5%
※註：1.資料來源，整理疾管署傳染病統計資料查詢系統資料(造訪日期106年4月)。