92 年起農委會推動現代化家禽衛生屠宰政策，除透過所屬農民學院舉辦各項訓練班及說明會，宣導農民落實禽場平日生物安全防治工作；並輔導設置非開放式禽舍；未於105年底前改善者，處新臺幣3萬元以上15萬元以下罰鍰。執行結果，105年度各縣市政府共計裁罰違規禽場22處；屠宰場衛生檢查方面，104年度至105年度每日屠檢人員對上市家禽進行衛生檢查結果，發現疑似病毒案例計有30批及21批，進一步檢驗後證實為陽性分別有27批及17批（如附表10），顯示病毒於屠宰場內傳播未能有效控制，民眾健康仍無保障。又觀之政府實施禁運措施將白肉雞排除，惟5月後爆發禽流感疫情多屬雞隻、500隻以下未登記牧場之禽場，政府亦無資料掌握，及車輛管制未落實等，皆導致國內禽流感防疫之漏洞。

此證監察院104年度糾正文亦驗證農委會督導國內家禽場落實生物安全措施，有關管控人員、車輛及載具尚有若干缺失，略以：「一般禽場對於防疫人員及化製車具備高度戒心，會要求防疫人員著防疫衣物或車輛消毒後再進入場區內、或要求化製車輛在場外收取斃死禽，但對飼料車、運禽車、運蛋車、藥品銷售人員、疫苗注射人員及業者之間交流等人車則不具戒心。」

附表10：104年度至106年度國內家禽屠宰衛生檢查情形

年度

全國家禽屠宰場數

衛生檢查人力(人)

執行檢查次數(次)

檢查比率(%)

疑似案例批數

檢測陽性批數

104

105

600

311,242,261

100

30

27

105

110

349/596

337,034,842

100

21

17

106

112

358/598

126,522,682

100

14

13

※註：1.資料來源，農委會防檢局。

2.106年度數據統計至5月17日止。

3.衛生檢查人力105與106年度區分為禽場/畜禽場。

4.執行檢查次數為每日屠檢人員進行逐隻檢查，次數為當年度總屠宰量。