中央政府各主管機關函送財團法人106年度預算案、營運及資金運用計畫至立法院者合計164家，以經濟部所轄40家財團法人為最多，農委會所轄30家財團法人次之；164家財團法人接受政府補助與委辦收入104年度決算數總計為494.64億元、105年度決算數530.09億元，106年度預算數485.46億元，其中以經濟部所轄財團法人之金額為最高，104年度決算數309.25億元、105年度決算數337.13億元，106年度預算數293.03億元，占164家財團法人接受政府補助與委辦金額之6成以上；其次為科技部所轄財團法人，104年度決算數70.95億元、105年度決算數72.59億元、106年度預算數68.65億元(詳附表2.1.1)。
部分主管機關所轄財團法人無需仰賴政府補助或委辦收入挹注財源，主要係因部分財團法人依法規命令設置，業務範圍以執行特定任務或公權力，並以特別公課為收入來源，例如金管會所轄財團法人金融消費評議中心、保險安定基金、證券投資人及期貨交易人保護中心、住宅地震保險基金及汽車交通事故特別補償基金等；或部分財團法人由政府捐助財產之孳息作為營運經費來源，例如行政院(國防部代管)所轄國防工業發展基金會依設置條例於68年成立時，政府捐助50億元，每年度營運經費即可由財務收入支應。爰若加計財團法人代行政府業務之收入，則政府對財團法人之財源挹注將更為可觀。
附表2.1.1：中央政府各主管機關所轄財團法人一覽表
單位：新臺幣億元
主管機關
所轄財團法人家數
政府補助與委辦收入
104年度決算數
105年度決算數
106年度預算數
行政院
1
0.00
0.00
0.00
內政部
8
1.86
1.95
1.97
文化部
14
26.80
27.07
27.83
外交部
3
13.58
13.04
12.73
交通部
10
0.47
0.48
0.52
法務部
3
0.84
2.40
2.87
金管會
9
0.21
0.21
0.02
原能會
3
0.03
0.01
0.01
退輔會
1
0.00
0.00
0.00
科技部
3
70.95
72.59
68.65
教育部
13
1.21
1.24
1.09
陸委會
2
1.87
1.67
1.62
通傳會
1
0.46
0.52
0.44
經濟部
40
309.25
337.13
293.03
農委會
30
17.66
17.97
19.40
僑委會
2
0.00
0.27
0.00
蒙委會
1
0.02
0.02
0.02
衛福部
16
35.77
37.83
38.48
環保署
2
0.89
0.82
0.87
原民會
1
3.17
3.45
3.43
司法院
1
9.60
11.40
12.49
合計
164
494.64
530.09
485.46
※註：1.資料來源，各主管部會彙總之財團法人填報資料，本研究彙整。
2.因四捨五入關係，或有尾差。