園區作業基金之收入來源係園區陸續開發完成，廠商進駐使用以及園區提供各項服務所致，包含有管理費收入、廠房土地租金收入、污水處理收入、實驗中學教學收入及其他收入等。105至113年度該基金收入自134.71億元成長至234.50億元，114年度預算案數再增至246.22億元，10年間增加(105至114年度，以下同)111.51億元(成長幅度82.78%)，該基金收入概呈逐年成長趨勢。

園區作業基金支出主要用於維護園區之運作、提供投資環境以及未來之發展，包含管理成本、園區與其周邊公共設施建設及維護之成本、污水處理服務成本、教學成本、出租資產成本、行政維持等支出。105至113年度該基金支出自104.92億元成長至156.13億元，114年度預算案數大幅增至197.58億元，10年間增加92.66億元(成長幅度88.31%)，該基金支出亦概呈逐年成長趨勢。

近10年來，園區作業基金執行結果，收入均大於支出，整體營運皆為賸餘，105至112年度決算之賸餘金額介於24.66至58.87億元間，113年度賸餘數大幅增加為78.37億元，詢據竹科管理局表示，係當年度園區廠商營運表現佳，營業額成長，管理收入隨之增加等原因所致；再以各園區餘絀情形觀之，均以竹科營運賸餘最高，由105年度之27.64億元增至113年度43.07億元(增幅55.82%)，中科及南科則餘絀互見，其中南科僅108年度為短絀，且近年營運實績提升，113年度決算賸餘數大幅成長為36.85億元(較105年度增幅達337.65%)(詳表2)。

表2 105至114年度園區作業基金收支餘絀情形表 單位：新臺幣億元

年度

收入

支出

餘絀

合計

竹科

中科

南科

105

134.71

104.92

29.79

27.64

-6.27

8.42

106

145.14

109.49

35.65

26.63

-3.36

12.38

107

148.70

109.77

38.93

27.91

-0.06

11.08

108

158.86

134.20

24.66

24.17

1.05

-0.56

109

173.65

132.98

40.67

28.28

4.76

7.63

110

190.04

136.06

53.98

34.30

5.90

13.78

111

210.12

151.25

58.87

40.75

12.45

5.67

112

207.64

154.48

53.16

33.83

1.45

17.88

113

234.50

156.13

78.37

43.07

-1.55

36.85

114

246.22

197.58

48.64

30.82

-3.00

20.81

說 明：105至113年度為決算審定數，114年度為預算案數。

資料來源：摘錄自園區作業基金各年度預、決算書。