衛福部及所屬中健保署皆以「健保財務健全及收支連動」為110年度施政重點之一；衛福部110年度預算案於「社會保險行政工作」編列2,859萬8千元，暨健保署110年度預算案於「健保業務」編列22億9,734萬6千元，支應健保制度之管理、監理、綜合規劃及財務等業務所需經費。經查：
(一)健保制度自84年開辦後，為解決財務收支問題，曾2次調升費率，並於102年實施二代健保，建立財務收支連動機制
我國健保制度自84年3月1日開辦後，曾於91年9月及99年4月調升費率，先由4.25%調為4.55%、再升至5.17%，主要係因醫療費用快速成長，保險費收入不足以支應所致，以99年4月為例，在費率調升前，累計短絀已達600餘億元，於費率調升後之101年2月健保財務即產生結餘。
嗣後衛福部推動二代健保改革，全民健康保險法(以下簡稱健保法)於100年1月26日修正公布，並自102年1月1日起實施保費新制，因擴大費基收繳補充保險費及政府總負擔比率提高等財源挹注，財務明顯改善，且該部全民健康保險會於104年11月20日決議訂定「健保財務平衡及收支連動機制」(以下簡稱健保連動機制)，確保健保財務之長期穩定，另於105年1月1日將保險費費率由4.91%降至4.69%，而補充保險費費率連動由2%調整為1.91%。
(二)依健保署評估報告結論，健保財務收支存在結構性失衡，若維持現行費率4.69%，每年財務收支成長逆差將逐年擴大，推估於110年安全準備將全數用罄
依健保法第25條規定，健保財務由保險人至少每5年精算1次，最近期健保署已於106年12月編製「106年度全民健康保險財務評估報告」，該報告結論指出，健保財務收支存在結構性失衡，於維持現行保險費率4.69%情況下，每年財務收支短絀將逐年持續擴大，預估110年財務收支短絀將達994 億元，且保險收支累計餘絀將轉為負數，安全準備於110年全數用罄。
(三)以健保連動機制推估，110年費率須調升至5.51%，並於113年再次調升，始能維持財務健全
據健保署提供以全民健康保險會研訂之健保連動機制推估(詳表1)，預估110年費率須調升為5.51%(調幅17.48%)，且預估113年再次調升費率至6.01%，將超過法定上限6%。衡酌健保費率對財務健全影響重大且事涉全民負擔，衛福部及健保署允宜周延審慎研擬相關政策，並及早妥謀因應。
表1 依健保連動機制推估109年至114年財務收支預估表
單位：新臺幣億元、月
項目
109年
110年
111年
112年
113年
114年
一般保險費率
4.69%
5.51%
5.51%
5.51%
6.00%
6.00%
補充保險費率
1.91%
2.24%
2.24%
2.24%
2.44%
2.44%
保險收入
6,276
7,471
7,604
7,731
8,523
8,635
保險成本
6,952
7,274
7,611
7,981
8,365
8,751
當年收支餘絀
-676
197
-7
-250
158
-116
累計餘絀
1,092
1,289
1,282
1,033
1,190
1,074
約當保險支出月數
1.88
2.13
2.02
1.55
1.71
1.47
說 明：109年依醫療給付費用總額協定成長率5.237%，110年依國家發展委員會於109年6月29日委員會議通過之上限4.5%，111年起依非協商及協商因素之歷史趨勢推估。又依機制預估113年需調升為6.01%，因超過法定上限6%，故以6%計算。
資料來源：健保署。
又由歷年健保安全準備餘額資料觀之(詳表2)，健保於84年開辦初期，全年度安全準備餘額約522.23億元，於91年度大幅滑落至86.63億元、98年度更出現短絀582.24億元，並於2次調升健保費率後，安全準備餘額始穩定累積至105年底之2,474.28億元，嗣因106年度至108年度健保收支再度分別短絀98.40億元、266.48億元、341.97億元，於108年底安全準備餘額持續滑落為1,767.43億元。復據健保署推估資料(詳表1)，預估109年底健保收支仍持續短絀，且攀升至676億元，在健保財務收支持續短絀下，恐侵蝕安全準備，不利健保之永續經營。
表2 歷年健保安全準備餘額概況表 單位：新臺幣億元
項目
84年6月底
85年6月底
91年底
98年底
101年底
餘額
173.07
522.23
86.63
-582.24
210.01
項目
104年底
105年底
106年底
107年底
108年底
餘額
2,288.71
2,474.28
2,375.88
2,109.40
1,767.43
說 明：因88年度以前會計年度之期間為上年度7月1日至該年度6月30日，經88年下半年及89年度調整後，90年度以後為歷年制。
資料來源：整理自健保署歷年公告之健保安全準備提列情形表。
綜上，健保乃國人健康照護之防護網，永續經營是全民共同期待，惟依健保署最近期財務評估報告指出健保財務收支存在結構性失衡，若維持現行費率4.69%，安全準備將於110年全數用罄，且以健保連動機制推估，保險費率須於110年調升至5.51%，始能維持財務健全。未來伴隨人口高齡化、醫療科技進步及需求日增等影響，健保財務缺口恐持續擴大而損及安全準備，肇致財務隱憂，亦恐對健保之永續經營產生負面影響，亟待賡續檢討及確保長期財務之穩健運作，俾利健保永續經營。