醫療藥品基金110 年度編列26家醫院門診醫療收入183億2,010萬3千元及住院醫療收入163億4,892萬6千元。經查：
(一)基隆醫院等12家醫院108年度門診病患醫療人次未達目標值
檢視108年度26家部立醫院營運目標執行情形(詳表1)，門診病患合計782萬673人次，較預算數增加6萬1,945人次(增幅0.80%)，尚符合預期；惟配合健保署對區域以上大醫院門診推行減量措施，以達分級醫療目標等因素，基隆醫院、臺北醫院、臺中醫院及彰化醫院等4家區域醫院門診病患醫療人次未達所訂目標值，分別較預算數減少2.32%、6.16%、3.91%及3.66%；又恆春旅遊醫院等8家醫院因臨近醫院競爭持續增加，及病患老化需轉診至鄰近綜合醫院就醫或檢查等，門診病患實際醫療人次較預算數減少6.65%至20.65%之間。
(二)南投醫院等11家醫院108年度住院病患醫療人日未達目標值
復檢視108年度26家部立醫院住院病患合計313萬1,746人日，較預算數增加2萬1,757人日(增幅0.70%)，整體執行情形尚符預期；然配合政府近年來為降低醫療資源不當耗用，推行安寧療護、服務績效佳之外科專任醫師離任及偏鄉羅致醫師不易等因素，南投醫院等11家醫院住院病患醫療人日未達所訂目標值，較預算數減少1.21%至24.77%之間。另臺東醫院及八里療養院等2家醫院108年度門診病患醫療人次、住院病患醫療人日均未達所訂目標值。
綜上，醫療藥品基金110 年度營運計畫揭櫫：「依醫院所在地人口數及競爭醫院，擬定目標項目，本年度預計診療門診病患818萬9,223人次，住院病患324萬792人日。」有鑑108年度基隆醫院等12家醫院(家數占比46.15%)門診病患醫療人次及南投醫院等11家醫院(家數占比42.31%)住院病患醫療人日均未達所訂目標值，允宜賡續策進。
表1 26家部立醫院108年度門診及住院之營運目標執行情形表
醫院名稱
門診病患醫療(人次)
住院病患醫療(人日)
預算數
決算數
增減數
增減%
預算數
決算數
增減數
增減%
總 計
7,758,728
7,820,673
61,945
0.80%
3,109,989
3,131,746
21,757
0.70%
基隆醫院
503,741
492,069
-11,672
-2.32%
75,613
80,940
5,327
7.05%
臺北醫院
594,641
557,999
-36,642
-6.16%
121,308
128,101
6,793
5.60%
桃園醫院
1,148,241
1,303,071
154,830
13.48%
302,536
326,445
23,909
7.90%
苗栗醫院
336,040
336,147
107
0.03%
94,000
96,658
2,658
2.83%
豐原醫院
791,124
797,520
6,396
0.81%
150,540
161,522
10,982
7.30%
臺中醫院
487,362
468,290
-19,072
-3.91%
122,316
130,338
8,022
6.56%
彰化醫院
323,440
311,597
-11,843
-3.66%
146,920
152,575
5,655
3.85%
南投醫院
408,000
455,723
47,723
11.70%
104,000
102,098
-1,902
-1.83%
嘉義醫院
165,000
167,499
2,499
1.51%
31,233
35,913
4,680
14.98%
朴子醫院
151,000
159,326
8,326
5.51%
49,500
50,033
533
1.08%
新營醫院
139,000
153,051
14,051
10.11%
62,700
60,546
-2,154
-3.44%
臺南醫院
386,604
402,628
16,024
4.14%
170,567
168,506
-2,061
-1.21%
旗山醫院
342,721
352,617
9,896
2.89%
107,695
102,986
-4,709
-4.37%
澎湖醫院
195,600
196,050
450
0.23%
54,603
48,497
-6,106
-11.18%
屏東醫院
356,313
369,739
13,426
3.77%
111,270
118,871
7,601
6.83%
恆春旅遊醫院
92,765
81,639
-11,126
-11.99%
9,837
10,679
842
8.56%
臺東醫院
114,322
106,724
-7,598
-6.65%
39,652
29,831
-9,821
-24.77%
花蓮醫院
213,340
169,278
-44,062
-20.65%
55,000
58,376
3,376
6.14%
玉里醫院
86,000
73,362
-12,638
-14.70%
190,000
186,950
-3,050
-1.61%
桃園療養院
137,622
143,796
6,174
4.49%
243,155
239,303
-3,852
-1.58%
八里療養院
32,000
27,464
-4,536
-14.18%
208,000
172,887
-35,113
-16.88%
草屯療養院
96,100
80,123
-15,977
-16.63%
355,600
359,394
3,794
1.07%
嘉南療養院
70,506
73,527
3,021
4.28%
179,924
177,629
-2,295
-1.28%
樂生療養院
236,000
197,364
-38,636
-16.37%
53,980
62,666
8,686
16.09%
胸腔病院
82,520
75,254
-7,266
-8.81%
21,540
23,695
2,155
10.00%
金門醫院
268,726
268,816
90
0.03%
48,500
46,307
-2,193
-4.52%
資料來源：審計部108年度決算審核通知及聲復事項。