疫苗基金110年度於「疫苗接種計畫」項下編列季節性流感疫苗9.74億元及補助流感疫苗處置費3.7億元，共計較109年度減少1.26億元，主要因預估流感疫苗採購單價下降所致。經查：
(一)近年來屢受國際疫苗市場供需失衡影響，導致接種時程延後，另部分公費疫苗外觀異常或施打產生副作用疑慮等事件，亦影響民眾接種意願
我國流感防疫預算自102年度起逐年遞增，105年度倍增為14億元，自108年度起改用四價流感疫苗，鑒於各縣市政府未及編列預算，當年度由食藥署支應，導致購置疫苗經費增加至12.49億元(詳表1)；因國內使用之疫苗大多須仰賴進口，近年來屢受國際疫苗市場供需失衡影響，導致多項疫苗交貨延遲問題，致無法銜接常規接種需求，如97至99年間發生水痘疫苗全球貨源短缺、101年國產日本腦炎疫苗停產，緊急自國外專案進口疫苗因應、103年經歷全球五合一疫苗貨源短缺危機，造成國內疫苗嚴重缺貨；另108年因世界衛生組織延遲公布北半球流感疫苗H3N2選株結果，影響疫苗生產及供貨期程，致接種時程延後，致部分接種作業亦延後至109年，故108年度處置費決算數僅為1.84億元。
表1 流感疫苗相關費用預、決算統計表 單位:新台幣千元
項目
105年度
106年度
107年度
108年度
109年度
110年度
流感疫苗購置費
預算
263,886
270,060
506,800
506,800
1,050,000
974,000
決算
546,158
448,757
414,072
1,249,150
-
-
處置費
預算
165,000
182,813
420,000
420,000
420,000
370,000
決算
412,000
406,935
346,236
184,616
-
-
資料來源：疫苗基金提供。
另107年接連爆發公費流感疫苗外觀變色、白色懸浮物、小黑點、小白點等流感疫苗不良品事件，引發國人對公費疫苗品質之疑慮，衝擊民眾施打疫苗信心，影響其接種意願，肇致當年流感疫苗接種率為22.4%，低於原訂目標值。
(二)109年公費流感疫苗接種情形踴躍，故先行暫緩無高風險慢性病之50至64歲成人接種，允宜密切掌握流感疫情資訊，並備妥應變措施
衛福部為維護國人健康，每年針對高危險群及高傳播群訂有流感疫苗接種計畫，近4年度公費疫苗全人口涵蓋率除107年度22.4%低於目標值外，其餘介於25.4%至25.5%，皆達成目標值25%。就接種對象分析，108年度醫事防疫人員、禽畜業者、國小、國中與高中職學生之接種率超過7成(詳表2)，而部分易受感染之高風險族群，如居住於社區之65歲以上長者、入學前幼童及其照顧者等，其流感疫苗接種率長期以來明顯偏低，108年度65歲以上長者及6個月至國小入學前幼兒分別提高至51.3%及54.2%，而50至64歲成人仍僅為18.7%。
然依據疾病管制署表示，109年公費流感疫苗民眾接種踴躍，自10月5日開打至10月14日止，流感疫苗已施打273.6萬劑(疫苗使用率45.3%)，經諮詢衛福部傳染病防治諮詢會預防接種組(ACIP)專家，建議依感染流感併發重症之風險，以65歲以上長者及6個月以上至國小入學前幼兒等主要流感高危險族群優先接種，故暫緩無高風險慢性病之50至64歲成人接種作業。是以，主管機關允宜密切掌握流感相關疫情資訊，並備妥應變措施因應。
表2 105至108年各類計畫對象流感疫苗接種率 單位：接種數；%
接種對象
105年
106年
107年
108年
65歲以上長者
49.2%
48.8%
44.5%
51.3%
50-64歲成人
20.0%
20.8%
18.1%
18.7%
6個月至國小入學前幼兒(至少一劑)
47.9%
49.5%
39.3%
54.2%
醫事防疫人員
78.2%
80.8%
74.17%
77.47%
禽畜業者
97.5%
99.9%
95.9%
100%
國小
74.3%
74.6%
67.6%
75.3%
國中
77.2%78.4%
73.2%
77.2%
高中/職
74.5%
77.4%
72.8%
81.5%
重大傷病/罕見疾病/高風險慢性病人(接種數)
102,354
221,817
142,236
123,224
孕婦/6個月內嬰兒父母/托育人員及托育機構專業人員 (接種數)
59,982
131,102
98,400
102,508
總接種數
6,024,294
5,992,500
5,314,078
5,996,925
公費疫苗全人口涵蓋率
25.5%
25.5%
22.4%
25.4%
說 明：接種數之定義為統計出生世代接受各項預防接種之人數（不分接種地點）。
資料來源：疫苗基金提供。
綜上，近年來屢受國際疫苗市場供需失衡影響，影響公費流感疫苗接種時程，復因費流感疫苗異常事件發生，使疫苗接種率下滑，而109年公費流感疫苗接種情形踴躍，現行暫緩無高風險慢性病之50至64歲成人接種，主管機關允宜密切掌握流感疫情資訊，並備妥應變措施因應，俾維護國民生命健康。