國發基金112年度預算案編列55億元直接投資各類企業，較111年度預算案減少10億元，減幅約15.38%。經查：
(一)近半數直接投資事業110年度營運虧損
檢視110年度國發基金之投資績效情形，截至年底計有直接投資66家民營事業，其中臺灣積體電路製造公司等33家公司獲有盈餘，占直接投資事業50.00%，餘33家事業，若不計入寶德電化材科技公司（已進入破產程序）無盈虧資訊之公司，營運發生虧損者32家，除110年度甫投資即虧損之樂迦再生科技、台杉水牛三號基金及台杉水牛五號基金等5家公司外，與109年度營運情形相較，虧損加劇者15家、由盈轉虧者2家、營運雖有改善，惟仍虧損者10家(詳表1)，上述公司虧損原因主要係新藥仍處研發階段、受新冠肺炎疫情影響營運收入、廠商削價競爭產品價格下跌等、仍處於投資布局階段、尚處業務轉型階段、廠房興建中等所致。
另國發基金為協助提升國內太陽能產業原料自製率，降低國內太陽能廠對國外結晶矽原料之依賴，為寶德公司籌措建廠資金等，103至108年陸續增資挹注寶德公司，累計投資合計14億3,587萬4千元，該公司原規劃109年繼續辦理現金增資，惟因無法獲得策略性投資人支持，且公司帳面資金已不足清償債務，無法繼續營運，於109年4月進入破產程序，據國發基金表示：寶德公司刻正進行破產程序，如破產後仍有賸餘財產，國發基金將依持股比例提出分配要求，該基金已將投資該公司金額14億3,587萬4千元認列投資損失，國發基金對於寶德公司之經營與財務狀況未能掌控，且未及時妥處，致使基金蒙受投資損失，允宜檢討原因並加強監督投資事業，以維護基金權益。
表1 國發基金110年度發生虧損之直接投資事業明細表
單位：新臺幣千元；%
類別
直接投資
事業名稱
投資
年月
110年底
淨利(損-)
投資金額
(成本)
持股 比率
108年
109年
110年
甫投資即虧損者
樂迦再生科技
110.5
280,000
14.00
-
-63
-34,518
台杉水牛三號基金
110.5
150,000
36.56
-
-
-25,422
台杉水牛五號基金
110.5
300,000
38.34
-
-
-23,949
英屬開曼群島商WeMo(Cayman)
110.12
31,440
3.16
-
-
-211,819
達佛羅
110.6
84,999
10.62
25,069
-164,063
-326,254
虧損
較109
年 度
增 加
者
藥華醫藥
92.9
271,312
7.97
-842,994
-1,948,142
-2,810,988
中裕新藥
99.9
399,320
15.83
-578,654
-183,304
-470,933
易達通科技
109.10
150,000
19.82
-
-6,819
-24,518
Gogoro Inc.
105.1
30,000
(千美元)
4.53
-6,251
(千美元)
-34,886
(千美元)
-64,357
(千美元)
益得生技
108.11
124,895
5.58
-311,424
-250,370
-301,756
世豐電力
109.7
552,000
20
61,861
-2,634
-8,560
Kkday Co.Ltd.
109.8
494,785
6.61
-35,226
(千美元)
-43,194
(千美元)
-55,499
(千美元)
兆遠科技
108.5
204,960
10.13
-751,496
-133,595
-317,303
如興
106.6
1,488,000
9.77
-1,043,633
-112,835
-1,910,021
炳碩生技
109.5
120,000
8.9
-55,832
-104,323
-129,462
義傳科技
109.2
201,202
16.31
-61,527
-99,089
-154,550
高雄捷運
91.1
1,257,000
13.84
61,509
-189,505
-319,963
東貝
108.1
104,500
2.83
-7,312,859
-1,254,350
-1,677,154
太極影音
94.12
400,000
18.22
-7,517
-10,621
-13,862
強方
109.10
160,000
19.49
-12,755
-19,338
-30,973
由盈轉虧者
豐達科技
90.6
332,852
7.17
350,824
59,832
-96,729
理想大地
90.8
800,000
10.04
-51,860
14,986
-43,797
虧損
較109
年度
減少
者
台康生技
102.4
412,800
5.09
-860,925
-1,041,670
-42,581
聯亞生技
87.10
700,000
19.98
-1,150,750
-694,749
-581,316
庫幣科技
109.3
151,100
5.17
-3,263
-5,649
-2,504
台灣花卉
87.5
100,000
6.57
-22,039
-39,666
-13,369
昱展新藥生技
109.4
50,000
3.50
-67,970
-142,797
-64,231
三顧
107.1
115,098
4.65
-92,695
-82,495
-53,381
一卡通
103.1
186,135
12.56
-122,198
-261,578
-191,974
聯合再生
107.10
1,442,640
6.09
-5,769,189
-6,162,307
-1,341,587
百德機械
109.3
65,000
2.96
-90,831
-352,551
-184,856
利翔航太
86.10
58,697
14,84
2,957
-57,572
-41,414
資料來源：國發基金提供。
(二)審計部連年針對國發基金直接投資事業長年虧損等提出重要審核意見
關於國發基金部分直接投資事業營運發生虧損，經營績效欠佳等，審計部自100年度起於中央政府總決算審核報告中每年均提出重要審核意見：
1.100年度至109年度重要審核意見指出：該基金未審慎評估投資效益與風險，復未積極監督公司營運及治理，且並未落實檢討公司經營困境及研提具體改善措施，轉投資事業長年經營績效不彰，營運持續發生虧損，所提改善措施成效有限，且部分事業因連年虧損，基金持股淨值已低於投資成本，又部分事業經釋股政策評估會議決議釋股，惟未辦理，允宜強化對投資事業之監督管理作為及檢討股權處理。
2.110年度再提出重要審核意見：部分轉投資事業如藥華醫藥、中裕新藥、聯亞生技開發、台康生技、台灣花卉生物技術等公司，國發基金已投資長達8至23年，惟仍持續因新藥研發成本高於收入等致公司長年虧損，營運狀況未獲顯著改善，另利翔航太電子、豐達科技、台灣高速鐵路等公司，受新型肺炎疫情影響，客戶取消訂單、乘客運量或旅客減少等，近2年度（109及110年度）營業收入衰退或營運業績由盈轉虧，允宜賡續注意該等投資事業營運情形，及時透過國發基金股權代表於董、監事會議提出建議，俾投資事業穩定經營。
(三)部分直接投資事業虧損情形未見改善
國發基金部分直接投資事業近年連年虧損，除寶德公司已依破產程序處理中外，於110年虧損32家公司中，連續虧損3年者高達21家，占65.63%，其中藥華醫藥、中裕新藥等公司呈逐年惡化趨勢，另藥華醫藥、Gogoro Inc.、Kkday Co.Ltd.、如興、東貝光電、聯合再生能源等6家公司110年虧損逾10億元，虧損情形嚴重，允宜加強監督以改善營運情形。
綜上，國發基金110年度直接投資66家民營事業，近半數直接投資事業110年度營運虧損，且部分事業連續虧損3年以上，審計部連年提出重要審核意見要求賡續注意投資事業營運情形，及時透過該基金股權代表於董、監事會議提出建議，允宜加強監督投資事業之營運及財務狀況並研擬因應對策，俾維護基金權益。