113年度編列「非營業特種基金」49.31億元，較112年度預算27.12億元，增加22.19億元。經查：
(一)113年度撥補非營業特種基金概況
113年度編列「非營業特種基金」49.31億元，包含撥補「經濟特別收入基金-中小企業發展基金」27.12億元(同112年度)，辦理促進中小企業發展等相關工作，另新增撥補「水資源作業基金」22.19億元，用以加強水資源管理及辦理水庫永續利用。彙整該2個非營業特種基金近年收支餘絀情形(詳表1及表2)，並說明如下：
1.中小企業發展基金(特別收入基金)：依中小企業發展條例第9條規定，中央主管機關應設置中小企業發展基金，用以支援或補助中小企業各項業務輔導或融資所需利息補貼等事項；另依中小企業發展基金收支保管及運用辦法第5條規定：「本基金之來源如下：一、中央政府逐年編列預算撥充。二、其他專案基金撥充。三、公民營企業團體或個人之捐贈。四、本基金之孳息收入。五、其他有關收入。」惟該基金近年收入來源逾9成為政府撥入收入，且金額及占比逐年增加，112及113年均逾27億元，占比高逾96%。詢據經濟部表示：中小企業發展基金除持續性輔導工作外，108年起配合行政院政策，分年新增辦理「中小企業加速投資行動方案」、「林口新創園國際創業聚落營運計畫」及「青年創業及啟動金貸款利息補貼業務」等重點業務，致基金支出大幅增加。
2.水資源作業基金(作業基金)：依水利法第89條之1第1項規定：中央主管機關得設置水資源作業基金，辦理水庫、海堤、河川或排水設施之管理、疏濬、災害搶修搶險、人才培訓及回饋措施等；另依水資源作業基金收支保管及運用辦法第3條規定：該基金收入來源包含由政府循預算程序之撥款、水利設施之使用費收入、清淤疏濬所得砂石之出售收入、耗水費收入及基金孳息收入等；該基金因給水銷貨收入不敷支應所需銷貨成本，致業務收支多呈短絀，110年因辦理乾旱水源緊急利用計畫及分擔停灌補償等支出致基金短絀逾36億元，另113年預計業務成本與費用率120.62%，係近3年最高，成本控管作業尚待強化。詢據經濟部113年度撥補22.19億元之原因及用途表示：主要用以水庫營運及設施管理、水庫清淤、更新改善及水資源調配等工作。
按中小企業發展基金及水資源作業基金分別屬預算法第4條第1項第2款所定，有特定收入來源而供特殊用途者之「特別收入基金」，以及凡經付出仍可收回，而用於非營業者之「作業基金」，惟中小企業發展基金主要收入來源為政府撥款收入，水資源作業基金112及113年度均預計呈短絀，營運績效均待檢討改善，允宜審酌基金收入來源，妥善規劃基金辦理事項，確切落實基金設立目的。
表1 110至113年度中小企業發展基金來源、用途及餘絀表 單位：新臺幣千元
年度
110決算
111決算
112預算
113預算案
基金來源
850,445
1,440,467
2,807,433
2,804,324
1.勞務收入
35,386
38,437
45,078
13,350
2.財產收入
31,203
35,021
40,871
69,226
3.政府撥入收入
774,432
1,363,037
2,719,180
2,719,180
4.其他收入
9,423
3,972
2,304
2,568
基金用途
1,275,846
1,793,183
2,705,270
2,770,580
1.中小企業發展計畫
1,274,260
1,791,420
2,702,904
2,768,185
2.一般行政管理計畫
1,586
1,763
2,366
2,395
本期賸餘(短絀)
-425,402
-352,717
102,163
33,744
期末基金餘額
1,266,574
913,857
1,016,020
1,049,764
政府撥入收入占基金來源比率
91.06%
94.62%
96.86%
96.96%
說 明：中小企業發展基金自112年起改為特別收入基金，所列110及111年決算數為該基金112及113年度預算所重分類之前年度決算數，表列112年度預算期末基金餘額為113年度預算案所列期初基金餘額。
資料來源：中小企業發展基金112及113年度預算書。
表2 110至113年度水資源作業基金(個別)收支餘絀表 單位：新臺幣千元
年度
110決算
111決算
112預算
113預算案
業務收入
8,098,713
10,473,295
9,307,126
8,896,187
1.勞務收入
38,313
45,789
46,121
46,973
2.銷貨收入
6,431,946
6,796,688
7,063,354
6,638,925
3.租金及權利金收入
4,807
4,304
10,218
16,416
4.徵收收入
1,399,698
1,398,277
1,890,746
1,897,186
5.其他業務收入
223,949
2,228,237
296,687
296,687
業務成本與費用
10,488,876
10,014,202
10,407,994
10,730,897
1.勞務成本
85,107
89,899
99,997
102,691
2.銷貨成本
8,199,007
7,645,223
7,590,180
7,897,413
3.業務費用
1,393,633
1,392,387
1,765,139
1,779,513
4.管理及總務費用
120,852
125,881
154,759
158,806
5.其他業務費用
690,277
760,812
797,919
792,474
業務餘絀
-2,390,163
459,094
-1,100,868
-1,834,710
業務外餘絀
-1,237,650
327,878
-61,178
-54,613
本期賸餘(短絀)
-3,627,813
786,917
-1,162,046
-1,889,323
期末基金餘額
74,963,422
73,993,938
74,871,051
79,591,220
國庫增撥數
0
0
0
2,219,000
業務成本與費用占營業收入比率
129.51%
95.62%
111.83%
120.62%
說 明：表列112年度預算期末基金餘額為113年度預算案所列期初基金餘額。
資料來源：水資源作業基金(個別)各年度預決算書。
(二)經濟部所屬非營業特種基金近2年營運或業務計畫未達目標項數偏高，允宜檢討並研謀改善
經濟部所屬非營業特種基金包含2個作業基金(經濟作業基金及水資源作業基金)及2個特別收入基金(經濟特別收入基金及核能發電後端營運基金)，參據審計部110及111年度總決算審核報告有關非營業特種基金營運(業務)計畫實施之考核；4個非營業特種基金110及111年度均訂定17項計畫，未達所訂年度目標項數分別13項(占比76.47%)及11項(占比64.71%)，逾半計畫未達預期目標，其中10項已連續2年未達目標值(詳表3)，允宜檢討並研謀改善。
表3 經濟部所屬非營業特種基金110及111年度營運(業務)計畫執行情形
項 目
110年度
111年度
營運(業務)計畫項數
17
17
已達預計目標項數
4
6
較預計目標減少項數
13
11
連續2年未達目標計畫情形
預計數
實際數
增減率%
預計數
實際數
增減率%
經濟作業基金
汙水處理營運
(千立方公尺)
83,041
76,430
-7.96
83,195
77,477
-6.87
水資源作業基金
給水(千立方公尺)
1,912,976
1,639,117
-14.32
1,893,646
1,739,450
-8.14
溫泉政策規劃及技術研究發展(千元)
5,000
3,425
-35.09
5,000
3,403
-31.93
經濟特別收入基金
貿易推廣工作計畫(千元)
6,131,205
4,157,516
-32.19
5,874,757
4,685,560
-20.24
政府儲油、石油開發及技術研究計畫
(千元)
5,507,779
4,797,719
-12.89
4,913,964
4,892,892
-0.43
再生能源推廣計畫(千元)
534,050
181,569
-66.00
595,275
188,110
-68.40
核能發電後端營運基金
低放射性廢棄物最終處置計畫(千元)
243,544
142,750
-41.39
320,701
132,771
-58.60
用過核子燃料貯
存計畫(千元)
1,019,795
472,337
-53.68
840,384
471,856
-43.85
用過核子燃料最終處置計畫(千元)
255,650
87,075
-65.94
250,993
195,775
-22.00
核子設施除役拆廠及其廢棄物處理及最終處置計畫(千元)
2,551,430
1,952,503
-23.47
2,694,883
2,057,338
-23.66
資料來源：審計部110及111年度中央政府總決算附屬單位決算及綜計表審核報告(非營業部分)。
綜上，經濟部113年度預算除同112年度撥補中小企業發展基金27.12億元外，新增撥補水資源作業基金22.19億元，辦理加強水資源管理事項，另所屬4個非營業特種基金111年度營運或業務計畫中計有10項計畫連續2年未達目標值，允宜檢討並研謀改善，以提高所屬非營業特種基金之營運績效。