台灣大學113年度預算案「業務收入－其他業務收入－其他補助收入」科目編列27億9,095萬2千元，其中教育部高等教育深耕計畫(以下稱高教深耕計畫)之補助收入18億6,500萬元；另資本門部分國庫撥款6億5,859萬3千元，其中獲高教深耕計畫補助購置機械及設備、交通及運輸設備、什項設備分別3億9,200萬元、1,300萬元及5,568萬7千元。茲說明如下：
(一)獲高教深耕等計畫之挹注經費逾458億元，近年QS及THE排名下降後雖略回升，惟高教國際競爭愈趨激烈，允宜賡續強化人才延攬、培育及提升研究能量
1.教育部為提升我國大學國際競爭力及高等教育水準，自95至105年度分2期推動邁向頂尖大學計畫(以下簡稱邁頂計畫)，106年度又展延1年經費，台灣大學共獲補助(扣除繳回數) 318億9,831萬6千元；而自107年度起教育部推動高教深耕計畫及玉山(青年)學者計畫，迄112年度上述2項計畫台灣大學獲補助數(扣除繳回數)139億3,925萬3千元(詳表1)；爰台灣大學自執行邁頂計畫及銜接執行高教深耕計畫以來，獲教育部挹注經費高達458.38億元，居各校之冠。
表1 台灣大學獲邁頂計畫及高教深耕、玉山(青年)學者計畫補助金額一覽表 單位：新臺幣千元
計畫別及期別
年度
實際或核定撥付經費
繳回數B
合計A-B
經常門
資本門
小計A
邁頂
計畫
第1期
95
1,800,000
1,200,000
3,000,000
-
3,000,000
96
1,650,000
1,350,000
3,000,000
2,017
2,997,983
97
1,500,000
1,500,000
3,000,000
-
3,000,000
98
1,500,000
1,500,000
3,000,000
-
3,000,000
99
1,500,000
1,500,000
3,000,000
21,245
2,978,755
邁頂
計畫
第2期
100
2,049,600
1,050,400
3,100,000
32
3,099,968
101
1,379,895
912,813
2,292,708
44
2,292,664
102
1,760,000
1,340,000
3,100,000
17
3,099,983
103
1,824,929
782,113
2,607,042
7,289
2,599,753
104
1,518,000
732,000
2,250,000
91,957
2,158,043
105
1,328,025
622,225
1,950,250
12,467
1,937,783
展延
106
1,224,115
524,621
1,748,736
15,352
1,733,384
邁頂計畫總計
19,034,564
13,014,172
32,048,736
150,420
31,898,316
高教深耕計畫第1期
107
1,549,213
250,787
1,800,000
4,448
1,795,552
108
1,806,149
447,015
2,253,164
1,990
2,251,174
109
1,903,424
470,283
2,373,707
4,893
2,368,814
110
1,866,120
460,611
2,326,731
3,881
2,322,850
111
1,865,184
460,687
2,325,871
26,356
2,299,515
高教深耕計畫第2期
112
1,928,584
537,910
2,466,494
-
2,466,494
深耕計畫總計
10,918,674
2,627,293
13,545,967
41,568
13,504,399
玉山學者計畫
107
15,164
-
15,164
1,287
13,877
108
35,907
-
35,907
1,349
34,558
109
52,714
-
52,714
2,287
50,427
110
86,332
-
86,332
512
85,820
111
115,482
-
115,482
-
115,482
112
131,785
2,905
134,690
-
134,690
高教深耕及玉山學者計畫總計
11,356,058
2,630,198
13,986,256
47,003
13,939,253
合計
30,390,622
15,644,370
46,034,992
197,423
45,837,569
說 明：95至111年度為決算數，112年度為核定數或預算數。
資料來源：台灣大學提供。
2.台灣大學統計年報顯示，該校SCI論文總數由94年度之3,378篇增至111年度之6,283篇，SSCI論文數則由94年度之150篇增至111年度之728篇；另據該校陳報教育部之高等教育深耕計畫第1期成果報告暨第2期修正計畫書(全校型計畫)列示，111年度在ESI之22個領域中，計有19個領域論文被引用總次數進入全球排名前1%，而SCI、SSCI及A&HCI論文被引用數為115萬5,643次、高被引論文839篇，均較94年度之13.6萬次及129篇大幅成長。
3.鑒於QS世界大學排名指標涵蓋面向較廣，台灣大學遂以提升QS排名作為邁頂計畫執行之整體目標。該校QS排名在2005年邁頂計畫未執行前為114名，邁頂計畫結束時已進入百大，高教深耕計畫執行期間於2020年上升為66名後逐年下降，而最新之QS排名69名(2023年公布)，已較2022年排名77名回升；而另一重要之世界大學排名系統為英國泰晤士高等教育(以下稱THE)之排名，其指標面向包含教學、研究、引文、國際展望、產業收入等項目，最重視被引用論文影響力，2010年台灣大學THE排名115名，排名雖曾上升為97名(2020年公布)，然2021及2022年因教學、研究及引文等3指標分數較低，名次退為187名，2023年排名雖回升為152名，惟仍未能進入百大。以上顯示高教國際競爭激烈，允宜賡續提升學術研究能量並發展多元領域以強化延攬及培育人才。
(二)中程校務發展計畫將於112學年度屆期，允宜因應國際發展趨勢及配合高教深耕計畫第2期重點項目，儘速提出適當規劃俾利校務發展
1.高教深耕計畫第2期(112至116年)預計總經費970億元，較第1期經費增加134億元，辦理面向除原有之「主冊-學校整體發展」、「附冊- USR計畫 」、「全校型計畫」、「特色領域研究中心計畫」及「附錄一-完善就學協助機制」、「附錄二-原住民就學輔導」等項目外，尚新增「主冊專章-國際化之行政支持系統及資安強化」面向，用以辦理擴大吸引及留用僑外生政策與強化大專校院資安管理；爰高教深耕計畫第2期推動重點旨在賡續強化多元特色以型塑明確定位及優勢之大學。而據台灣大學所擬高等教育深耕計畫第1期成果報告暨第2期修正計畫書所列之未來發展指出，2022年已與日本京都大學比肩，將訂定日本東京大學為短中程標竿學校(2027年)，美國UCLA 為長程標竿學校；鑒於台灣大學獲邁頂及高教深耕等計畫挹注經費高達458億餘元，為全台大學之冠，然近年日本京都大學QS及THE排名均進入百大，與該校排名尚有落差，允宜配合高教深耕計畫第2期推動項目，賡續精進教學、研究相關執行策略。
2.另台灣大學係我國最具代表性大學，據所訂108至112學年度中程校務發展計畫指出，該校中長程目標係成為「亞洲頂尖、引領臺灣」之大學，對校內一級單位之發展目標、策略及執行方式亦訂有相關考評項目及指標。鑒於該校中程校務發展計畫將於112學年度屆期，而校務發展計畫係引導大學校務推動及永續經營之策略方向，且依大學法第16條規定，校務發展計畫及預算需經校務會議審議，允宜因應國際發展趨勢及配合高教深耕計畫第2期推動重點，儘速提出適當規劃，俾引導校務正向及永續發展。
綜上，在政府長期挹注龐巨經費及台灣大學努力下，該校學術研究能量雖獲致質量俱增成果，惟近年高教國際競爭愈趨激烈，允宜賡續提升研究量能並發展多元領域以強化延攬及培育人才；另台灣大學中程校務發展計畫將於112學年度屆期，允宜因應國際發展趨勢及配合高教深耕計畫第2期重點項目，儘速提出適當規劃，俾利校務正向發展。