教育部所屬基金設立宗旨除賦予各館業務之發展空間及增加經費運用之彈性外，更期能促進開源節流以利自給自足。該基金114年度預算案短絀5億439萬5千元，較113年度預算案減少短絀798萬1千元（減幅1.56%），主要係教學收入及社教機構發展補助收入增加數，高於服務成本及教學成本增加數所致。經查：
(一)教育部所屬基金為作業基金，雖不以營利為目的，仍宜朝向自給自足方式經營
1.預算法第4條第1項第2款第4目規定：「凡經付出仍可收回，而非用於營業者，為作業基金。」
2.教育部所屬機構作業基金設置條例第1條規定：「教育部為因應所屬機構發展趨勢，提升社會教育及教育研究品質，增進財務經營管理之能力，設置教育部所屬機構作業基金，特制定本條例。」
3. 114年度中央政府總預算附屬單位預算編製辦法第3條第2項規定：「作業基金預算之編製，應本財務自給自足原則，設法提升業務績效，降低生產或服務之單位成本，以達成最佳效益目標。」
是以，教育部所屬基金為作業基金，雖不以營利為目的，仍宜以財務自給自足方式經營，逐步擴展自償性財源，並強化營運及財務效能，以提升業務績效，俾達成提升社會教育及教育研究品質之宗旨。
(二)收入主要仰賴政府補助且連年短絀，允宜研謀提升營運績效
教育部所屬基金6個分基金114年度預算案收入不敷成本與費用，均為短絀，且政府補助收入占各分基金總收入之比率介於52.16%至74.91%間（詳表1），總收入中65.35%之收入係仰賴政府補助。
表1 教育部所屬機構作業基金114年度預算案收支預計表
單位:新臺幣千元；%
科目
合計
國立自然科學博物館
國立科 學工藝 博物館
國立海洋生物博物館
國立臺灣科學教育館
國立臺灣圖書館
國立海 洋科技 博物館
總收入
2,331,768
778,417
403,678
241,735
265,238
309,332
333,368
政府補助收入
1,523,793
583,117
262,656
129,173
175,874
199,088
173,885
政府補助收入占總收入百分比
65.35
74.91
65.07
53.44
66.31
64.36
52.16
自籌收入
807,975
195,300
141,022
112,562
89,364
110,244
159,483
總支出
2,836,163
836,698
520,791
343,564
367,870
377,109
390,131
本期賸餘
(短絀)
-504,395
-58,281
-117,113
-101,829
-102,632
-67,777
-56,763
資料來源：教育部所屬基金114年度預算案。
復觀察109至112年度教育部所屬基金決算之收支情形(詳表2)，扣除政府機關補助後之其他各項收入合計介於5億7,060萬4千元至8億7,813萬1千元間，占比介於28.07%及39.35%間。而該基金109年度收支短絀為4億6,229萬1千元，至110年度短絀數增加至5億1,567萬元，111及112年度略降，惟113及114年度預算案之短絀亦均逾5億元。以上顯示該基金收入主要仰賴政府資源挹注，惟連年短絀、未能自給自足，與預算法作業基金之設置精神未盡洽合。
綜上，教育部所屬基金連年短絀，109至112年度決算收支皆為短絀，且近年收入主要來自政府補助，而113及114年度預算案預計短絀均逾5億元，與預算法設置作業基金以提升營運績效及自給自足之設置宗旨，未盡洽合，允宜研謀改善。
表2 教育部所屬基金109至114年度收支情形表
單位:新臺幣千元
收支項目
109年度
決算數
110年度
決算數
111年度
決算數
112年度
決算數
113年度
預算案數
114年度預算案
收入合計
2,231,520
2,033,046
2,217,718
2,459,217
2,192,325
2,331,768
政府補助收入
1,353,389
1,462,442
1,486,957
1,599,350
1,458,981
1,523,793
其他各項收入合計
878,131
570,604
730,761
859,867
733,344
807,975
費用合計
2,693,811
2,548,716
2,705,855
2,898,857
2,704,701
2,836,163
本期賸餘（短絀）
(462,291)
(515,670)
(488,137)
(439,640)
(512,376)
(504,395)
資料來源：教育部所屬基金109至114年度預、決算書。