教育部所屬基金各館所除辦理社會科學教育之展覽與劇場演出活動等館務服務外，亦負有與其主要職掌相關生物標本或文物之採集、蒐藏及研究(不含臺灣圖書館中山樓)。114年度科博館、科工館及海生館皆將在專業學術期刊發表科學文獻用指標論文(SCI)數列為提升專業研究水準之績效衡量指標，該基金114年度預算案編列專業研究(不含科普及科學教育通俗性)相關經費計1億4,008萬5千元 (詳表1)。
表1 110至114年度教育部所屬基金各分基金專業研究 (不含科普及科學教育通俗性)相關經費統計表 單位:新臺幣千元
機構別
110年度
決算數
111年度
決算數
112年度
決算數
113年度
預算案
114年度
預算案
國立自然科學博物館
106,375
104,274
120,866
106,000
107,000
國立科學工藝博物館
180
178
87
1,280
1,012
國立海洋生物博物館
2,474
2,206
2,279
2,280
2,505
國立臺灣科學教育館
809
847
610
720
720
國立海洋科技博物館
16,202
18,950
22,470
24,609
28,848
合計
126,040
126,455
146,312
134,889
140,085
說 明：科博館包含建教合作成本及部門經費(含計畫主持人費及計畫專(兼)任助理薪資)；科工館為科技文物徵集研究與維護經費；海生館包含海域生態監測-後灣生態及水質計畫與各主題研究計畫經費；科教館為推廣教育經費；海科館為研究人員用人費用。
資料來源：彙整自教育部所屬基金各分基金提供資料。
由教育部所屬基金各館所(不含臺灣圖書館)108年度至113年7月底國外專業或學術期刊發表論文數(詳表2）觀之，整體SCI發表篇數由108年度107篇增為111年度120篇，112年度則僅85篇，為該期間最低；至其他國外發表篇數亦由108年度33篇，減為112年度23篇。由個別館所觀之，112年度除科工館其他國外篇數較111年度增加及科教館同為1篇外，其餘館所不論SCI或其他國外發表篇數皆低於111年度，允宜研謀改善。
綜上，教育部所屬基金各館所負有與其主要職掌相關生物標本或文物之採集、蒐藏及研究，並將在專業學術期刊發表科學文獻用指標論文(SCI)數列為提升專業研究水準之績效衡量指標，然112年度多數館所之國外專業學術期刊發表論文數，係108年度以來最低，允宜研謀改善，俾提升專業研究水準。
表2 108年度至113年7月底教育部所屬基金各分基金於國外專業或學術期刊發表論文數統計表 單位:篇
機構別/年度
108
109
110
111
112
113
國立自然科學博物館
SCI
17
22
29
21
17
7
其他國外
24
25
24
19
11
3
國立科學工藝博物館
SCI
1
1
1
1
0
0
其他國外
8
3
2
4
11
8
國立海洋生物博物館
SCI
79
71
71
87
63
24
其他國外
0
0
0
0
0
0
國立臺灣科學教育館
SCI
7
1
2
5
2
2
其他國外
0
0
0
1
1
0
國立海洋科技博物館
SCI
3
3
0
6
3
0
其他國外
1
1
0
1
0
0
總計
SCI
107
98
103
120
85
33
其他國外
33
29
26
25
23
11
說 明：113年為截至7月底實際數。
資料來源：彙整自教育部所屬基金各分基金提供資料。