農業特別收入基金114年度分別編列基金來源464億4,509萬1千元，基金用途611億6,167萬6千元，收支相抵後，預計短絀147億1,658萬5千元，較113年度預算短絀152億422萬9千元，短絀減少4億8,764萬4千元(減幅3.21%)。經查：
(一)特別收入基金預算編列及執行相關規範
1.預算法第4條第1項第2款第5目規定略以，有特定收入來源而供特殊用途者，為特別收入基金。
2.附屬單位預算執行要點第4點第4項規定略以，政事基金應在法律或政府指定之財源範圍內，妥善規劃整體財務資源，加強財務控管，並設法提升資源之使用效率，以達成基金設立目的及年度施政目標。
3.中央政府非營業特種基金裁撤機制辦法第4條規定略以，特別收入基金之基金餘額為負數，或不含短期債務之可用資金不足者，應加強財務控管；如無新增適足財源，其支出不得超出年度預算總額，並由主管機關提出改善計畫，進行專案輔導改善。
(二)109年度國庫撥足農再基金法定撥補額度後，農業特別收入基金已連續3年短絀，113及114年度預計短絀均逾140億元
國庫於100至109年度陸續依農村再生條例規定撥足農再基金之法定撥補金額1,500億元後，自110年度起不再撥補，僅按業務需求撥補農發基金、天災救助基金及農損基金以推動農業措施，農業特別收入基金之基金來源銳減，110至112年度決算短絀分別為107億6,940萬9千元、29億2,094萬9千元及92億4,970萬元，且113及114年度預計短絀數均逾140億元，基金餘額逐年縮減，預計至114年底基金餘額為424億8,273萬4千元，較110年度減少451億2,547萬5千元（詳表1）。
表1 農業特別收入基金110至114年度基金收支餘絀明細表
單位：新臺幣千元
項目
110年度
決算數
111年度
決算數
112年度
決算數
113年度預算案數
114年度
預算案數
基金來源
41,022,432
47,140,114
48,632,413
40,322,137
46,445,091
基金用途
51,791,841
50,061,063
57,882,114
55,526,366
61,161,676
本期賸餘（短絀）
-10,769,409
-2,920,949
-9,249,700
-15,204,229
-14,716,585
期初基金餘額
98,377,618
87,608,209
84,687,260
67,557,755
57,199,319
期末基金餘額
87,608,209
84,687,260
75,437,560
52,353,526
42,482,734
資料來源：農業特別收入基金歷年預、決算書。
(三)部分分基金連年短絀致基金餘額逐年銳減，部分分基金則因可用資金不足尚須調度資金以維持正常運作，允宜加強財務管理
檢視110至112年度農業特別收入基金各分基金之基金來源、用途及餘絀情形（詳表2），其中天災救助基金及農損基金等2個分基金，政府公庫撥款收入占基金來源比率逾9成，而農發基金除了原撥款收入衍生之利息及收回以前年度補助賸餘款，無其他收入，均高度仰賴國庫撥款挹注，缺乏國庫撥款以外之適足財源，惟天災救助基金110年度因入不敷出致短絀，110及111年底基金餘額均呈負值；而農損基金110年度亦為短絀，財務控管欠佳；又農再基金之基金來源無法支應各項業務計畫所需經費，110至112年度均為短絀，且均逾百億元，致基金餘額逐年銳減；另天災救助基金及農發基金均因可用資金不足，連年向農再基金調度資金以維持基金正常運作(詳表2)。允宜督促檢討妥善規劃基金整體財務資源，或研議增加公庫撥補以外之適足財源，並強化財務管理，俾利基金永續經營。
表2 農業特別收入基金110至112年度基金來源、用途及餘絀情形明細表 單位：新臺幣千元
分基金別
年度
基金來源
基金
用途
本期賸餘
(短絀-)
期末基金
餘額
公庫撥款收入
其他
合計
農發
基金
110
17,243,979
6,839,231
24,083,210
19,810,085
4,273,125
1,725,739
111
20,259,659
7,010,770
27,270,429
22,134,000
5,136,429
6,862,167
112
18,217,540
6,355,986
24,573,526
22,405,953
2,167,573
9,029,740
林務
基金
110
-
1,553,048
1,553,048
2,357,066
-804,018
7,579,022
111
-
1,781,396
1,781,396
1,360,404
420,992
8,000,014
112
-
1,699,891
1,699,891
1,375,899
323,993
8,324,007
天災救助基金
110
2,311,579
2,558
2,314,137
4,119,531
-1,805,394
-615,840
111
3,213,762
5,636
3,219,398
3,132,746
86,653
-529,188
112
5,181,045
9,770
5,190,815
3,595,295
1,595,520
1,066,332
漁發
基金
110
0
458
458
32,446
-31,988
153,869
111
0
751
751
14,970
-14,219
139,649
112
0
957
957
12,982
-12,025
127,624
農損
基金
110
11,853,090
1,127,356
12,980,446
13,472,655
-492,209
1,317,794
111
13,605,103
1,156,698
14,761,801
12,854,734
1,907,066
3,224,860
112
15,994,293
1,092,011
17,086,304
16,817,090
269,214
3,494,074
農再
基金
110
0
91,132
91,132
12,000,057
-11,908,925
77,447,625
111
0
106,339
106,339
10,564,209
-10,457,869
66,989,756
112
0
80,920
80,920
13,674,894
-13,593,974
53,395,782
資料來源：農業特別收入基金歷年決算書。
表3 農發基金及天災救助基金110至112年度向農再基金調度資金明細表 單位：新臺幣千元
年度
農發基金短期借款年底餘額
天災救助基金短期借款年底餘額
110
6,723,834
1,060,283
111
1,529,424
1,060,283
112
3,050,867
213,000
資料來源：農業特別收入基金歷年決算書及審計部112年度審核報告-非營業部分。
綜上，農業特別收入基金110至112年度決算連續3年短絀，其中天災救助基金、農損基金及農再基金等分基金均曾因入不敷出而短絀，天災救助基金110及111年度淨值甚至降為負數，而農再基金因連年鉅額短絀致基金餘額銳減，且天災救助基金與農發基金均因可用資金不足致須調度資金維持正常運作。114年度農業特別收入基金預計短絀數高達147億1,658萬5千元，允宜妥善規劃整體財務資源，並加強財務管理，俾利基金永續經營。